Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TUBB8Q3ZCM7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TUBB8Q3ZCM7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TUBB8Q3ZCM7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TUBB8Q3ZCM7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TUBB8Q3ZCM7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TUBB8Q3ZCM7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TUBB8Q3ZCM7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBB8Q3ZCM7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBB8Q3ZCM7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBB8Q3ZCM7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBB8Q3ZCM7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBB8Q3ZCM7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TUBB8Q3ZCM7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TUBB8Q3ZCM7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TUBB8Q3ZCM7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBB8Q3ZCM7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TUBB8Q3ZCM7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TUBB8Q3ZCM7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TUBB8Q3ZCM7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TUBB8Q3ZCM7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TUBB8Q3ZCM7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TUBB8Q3ZCM7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TUBB8Q3ZCM7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBB8Q3ZCM7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBB8Q3ZCM7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TUBB8Q3ZCM7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TUBB8Q3ZCM7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TUBB8Q3ZCM7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TUBB8Q3ZCM7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TUBB8Q3ZCM7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TUBB8Q3ZCM7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TUBB8Q3ZCM7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TUBB8Q3ZCM7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TUBB8Q3ZCM7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TUBB8Q3ZCM7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TUBB8Q3ZCM7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TUBB8Q3ZCM7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TUBB8Q3ZCM7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBB8Q3ZCM7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBB8Q3ZCM7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TUBB8Q3ZCM7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TUBB8Q3ZCM7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TUBB8Q3ZCM7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TUBB8Q3ZCM7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TUBB8Q3ZCM7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TUBB8Q3ZCM7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TUBB8Q3ZCM7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TUBB8Q3ZCM7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TUBB8Q3ZCM7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TUBB8Q3ZCM7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBB8Q3ZCM7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBB8Q3ZCM7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBB8Q3ZCM7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TUBB8Q3ZCM7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TUBB8Q3ZCM7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TUBB8Q3ZCM7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBB8Q3ZCM7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBB8Q3ZCM7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBB8Q3ZCM7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBB8Q3ZCM7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBB8Q3ZCM7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBB8Q3ZCM7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBB8Q3ZCM7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBB8Q3ZCM7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TUBB8Q3ZCM7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBB8Q3ZCM7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBB8Q3ZCM7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBB8Q3ZCM7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBB8Q3ZCM7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TUBB8Q3ZCM7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TUBB8Q3ZCM7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TUBB8Q3ZCM7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TUBB8Q3ZCM7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TUBB8Q3ZCM7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TUBB8Q3ZCM7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TUBB8Q3ZCM7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBB8Q3ZCM7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBB8Q3ZCM7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBB8Q3ZCM7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TUBB8Q3ZCM7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBB8Q3ZCM7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBB8Q3ZCM7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBB8Q3ZCM7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBB8Q3ZCM7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBB8Q3ZCM7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TUBB8Q3ZCM7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUBB8Q3ZCM7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBB8Q3ZCM7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBB8Q3ZCM7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TUBB8Q3ZCM7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TUBB8Q3ZCM7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TUBB8Q3ZCM7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TUBB8Q3ZCM7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBB8Q3ZCM7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBB8Q3ZCM7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TUBB8Q3ZCM7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBB8Q3ZCM7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBB8Q3ZCM7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBB8Q3ZCM7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms