Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPTX1Q15818 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPTX1Q15818 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NPTX1Q15818 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPTX1Q15818 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPTX1Q15818 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPTX1Q15818 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPTX1Q15818 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NPTX1Q15818 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPTX1Q15818 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPTX1Q15818 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPTX1Q15818 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NPTX1Q15818 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPTX1Q15818 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPTX1Q15818 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPTX1Q15818 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPTX1Q15818 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPTX1Q15818 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPTX1Q15818 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPTX1Q15818 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPTX1Q15818 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPTX1Q15818 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPTX1Q15818 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPTX1Q15818 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPTX1Q15818 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPTX1Q15818 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPTX1Q15818 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPTX1Q15818 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPTX1Q15818 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPTX1Q15818 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPTX1Q15818 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPTX1Q15818 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPTX1Q15818 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPTX1Q15818 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPTX1Q15818 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPTX1Q15818 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPTX1Q15818 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPTX1Q15818 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPTX1Q15818 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPTX1Q15818 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPTX1Q15818 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPTX1Q15818 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPTX1Q15818 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPTX1Q15818 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPTX1Q15818 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPTX1Q15818 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPTX1Q15818 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPTX1Q15818 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPTX1Q15818 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPTX1Q15818 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPTX1Q15818 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPTX1Q15818 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPTX1Q15818 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPTX1Q15818 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPTX1Q15818 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPTX1Q15818 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPTX1Q15818 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPTX1Q15818 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPTX1Q15818 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPTX1Q15818 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPTX1Q15818 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPTX1Q15818 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPTX1Q15818 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPTX1Q15818 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPTX1Q15818 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPTX1Q15818 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPTX1Q15818 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPTX1Q15818 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPTX1Q15818 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPTX1Q15818 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPTX1Q15818 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPTX1Q15818 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPTX1Q15818 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPTX1Q15818 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPTX1Q15818 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPTX1Q15818 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPTX1Q15818 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPTX1Q15818 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPTX1Q15818 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPTX1Q15818 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPTX1Q15818 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPTX1Q15818 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPTX1Q15818 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPTX1Q15818 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPTX1Q15818 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPTX1Q15818 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPTX1Q15818 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPTX1Q15818 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPTX1Q15818 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPTX1Q15818 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPTX1Q15818 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPTX1Q15818 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPTX1Q15818 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPTX1Q15818 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPTX1Q15818 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPTX1Q15818 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPTX1Q15818 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPTX1Q15818 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPTX1Q15818 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NPTX1Q15818 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms