Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NPTX1Q15818 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPTX1Q15818 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPTX1Q15818 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NPTX1Q15818 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NPTX1Q15818 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NPTX1Q15818 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NPTX1Q15818 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NPTX1Q15818 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NPTX1Q15818 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NPTX1Q15818 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPTX1Q15818 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NPTX1Q15818 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NPTX1Q15818 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NPTX1Q15818 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NPTX1Q15818 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NPTX1Q15818 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPTX1Q15818 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPTX1Q15818 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPTX1Q15818 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPTX1Q15818 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPTX1Q15818 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPTX1Q15818 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPTX1Q15818 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPTX1Q15818 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPTX1Q15818 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPTX1Q15818 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPTX1Q15818 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPTX1Q15818 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPTX1Q15818 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPTX1Q15818 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPTX1Q15818 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPTX1Q15818 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPTX1Q15818 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPTX1Q15818 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPTX1Q15818 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPTX1Q15818 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPTX1Q15818 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPTX1Q15818 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPTX1Q15818 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPTX1Q15818 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPTX1Q15818 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPTX1Q15818 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPTX1Q15818 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPTX1Q15818 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPTX1Q15818 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPTX1Q15818 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPTX1Q15818 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPTX1Q15818 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPTX1Q15818 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPTX1Q15818 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPTX1Q15818 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPTX1Q15818 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPTX1Q15818 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPTX1Q15818 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPTX1Q15818 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPTX1Q15818 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPTX1Q15818 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPTX1Q15818 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NPTX1Q15818 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPTX1Q15818 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPTX1Q15818 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPTX1Q15818 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPTX1Q15818 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPTX1Q15818 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPTX1Q15818 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPTX1Q15818 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPTX1Q15818 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPTX1Q15818 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPTX1Q15818 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPTX1Q15818 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPTX1Q15818 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPTX1Q15818 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPTX1Q15818 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPTX1Q15818 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPTX1Q15818 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPTX1Q15818 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPTX1Q15818 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPTX1Q15818 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPTX1Q15818 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPTX1Q15818 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPTX1Q15818 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPTX1Q15818 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPTX1Q15818 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPTX1Q15818 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPTX1Q15818 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPTX1Q15818 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPTX1Q15818 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPTX1Q15818 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPTX1Q15818 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPTX1Q15818 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPTX1Q15818 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPTX1Q15818 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPTX1Q15818 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPTX1Q15818 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPTX1Q15818 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPTX1Q15818 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NPTX1Q15818 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NPTX1Q15818 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPTX1Q15818 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1155.9 ms