Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB40BQ12829 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB40BQ12829 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB40BQ12829 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB40BQ12829 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB40BQ12829 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB40BQ12829 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB40BQ12829 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB40BQ12829 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB40BQ12829 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB40BQ12829 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB40BQ12829 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB40BQ12829 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB40BQ12829 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB40BQ12829 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB40BQ12829 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB40BQ12829 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB40BQ12829 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB40BQ12829 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB40BQ12829 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB40BQ12829 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB40BQ12829 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB40BQ12829 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB40BQ12829 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB40BQ12829 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB40BQ12829 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB40BQ12829 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB40BQ12829 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB40BQ12829 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB40BQ12829 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB40BQ12829 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB40BQ12829 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB40BQ12829 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB40BQ12829 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB40BQ12829 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB40BQ12829 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB40BQ12829 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB40BQ12829 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB40BQ12829 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB40BQ12829 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB40BQ12829 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB40BQ12829 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB40BQ12829 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RAB40BQ12829 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB40BQ12829 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB40BQ12829 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB40BQ12829 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB40BQ12829 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB40BQ12829 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB40BQ12829 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB40BQ12829 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB40BQ12829 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB40BQ12829 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB40BQ12829 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB40BQ12829 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB40BQ12829 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB40BQ12829 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB40BQ12829 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB40BQ12829 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB40BQ12829 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB40BQ12829 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB40BQ12829 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB40BQ12829 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB40BQ12829 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB40BQ12829 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB40BQ12829 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB40BQ12829 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB40BQ12829 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB40BQ12829 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB40BQ12829 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB40BQ12829 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB40BQ12829 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB40BQ12829 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB40BQ12829 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB40BQ12829 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB40BQ12829 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB40BQ12829 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB40BQ12829 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB40BQ12829 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB40BQ12829 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB40BQ12829 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB40BQ12829 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB40BQ12829 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB40BQ12829 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB40BQ12829 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB40BQ12829 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB40BQ12829 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB40BQ12829 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB40BQ12829 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB40BQ12829 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB40BQ12829 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB40BQ12829 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB40BQ12829 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB40BQ12829 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB40BQ12829 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB40BQ12829 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB40BQ12829 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB40BQ12829 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB40BQ12829 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB40BQ12829 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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