Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
IRX6P78412 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
IRX6P78412 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
IRX6P78412 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
IRX6P78412 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
IRX6P78412 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
IRX6P78412 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
IRX6P78412 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
IRX6P78412 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
IRX6P78412 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
IRX6P78412 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
IRX6P78412 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
IRX6P78412 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
IRX6P78412 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IRX6P78412 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
IRX6P78412 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
IRX6P78412 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
IRX6P78412 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
IRX6P78412 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
IRX6P78412 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
IRX6P78412 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
IRX6P78412 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
IRX6P78412 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
IRX6P78412 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
IRX6P78412 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
IRX6P78412 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
IRX6P78412 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
IRX6P78412 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
IRX6P78412 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
IRX6P78412 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
IRX6P78412 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
IRX6P78412 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
IRX6P78412 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
IRX6P78412 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
IRX6P78412 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
IRX6P78412 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
IRX6P78412 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
IRX6P78412 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
IRX6P78412 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
IRX6P78412 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
IRX6P78412 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
IRX6P78412 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
IRX6P78412 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
IRX6P78412 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
IRX6P78412 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
IRX6P78412 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
IRX6P78412 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
IRX6P78412 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
IRX6P78412 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
IRX6P78412 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
IRX6P78412 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
IRX6P78412 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
IRX6P78412 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
IRX6P78412 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
IRX6P78412 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
IRX6P78412 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
IRX6P78412 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
IRX6P78412 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
IRX6P78412 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
IRX6P78412 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
IRX6P78412 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
IRX6P78412 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
IRX6P78412 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
IRX6P78412 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
IRX6P78412 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
IRX6P78412 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
IRX6P78412 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
IRX6P78412 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
IRX6P78412 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
IRX6P78412 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
IRX6P78412 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
IRX6P78412 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
IRX6P78412 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
IRX6P78412 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
IRX6P78412 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
IRX6P78412 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
IRX6P78412 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
IRX6P78412 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
IRX6P78412 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
IRX6P78412 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
IRX6P78412 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
IRX6P78412 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
IRX6P78412 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
IRX6P78412 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
IRX6P78412 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
IRX6P78412 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
IRX6P78412 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
IRX6P78412 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
IRX6P78412 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
IRX6P78412 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
IRX6P78412 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
IRX6P78412 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
IRX6P78412 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
IRX6P78412 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
IRX6P78412 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
IRX6P78412 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
IRX6P78412 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
IRX6P78412 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
IRX6P78412 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
IRX6P78412 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms