Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.92■■■■■ 4.62
IRX6P78412 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
IRX6P78412 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
IRX6P78412 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
IRX6P78412 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
IRX6P78412 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
IRX6P78412 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
IRX6P78412 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.29■■■■■ 4.36
IRX6P78412 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
IRX6P78412 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
IRX6P78412 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
IRX6P78412 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
IRX6P78412 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
IRX6P78412 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
IRX6P78412 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
IRX6P78412 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
IRX6P78412 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
IRX6P78412 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
IRX6P78412 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
IRX6P78412 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
IRX6P78412 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
IRX6P78412 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
IRX6P78412 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
IRX6P78412 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
IRX6P78412 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
IRX6P78412 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
IRX6P78412 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
IRX6P78412 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
IRX6P78412 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
IRX6P78412 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
IRX6P78412 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
IRX6P78412 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
IRX6P78412 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
IRX6P78412 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
IRX6P78412 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
IRX6P78412 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
IRX6P78412 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
IRX6P78412 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
IRX6P78412 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
IRX6P78412 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
IRX6P78412 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
IRX6P78412 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
IRX6P78412 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
IRX6P78412 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
IRX6P78412 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
IRX6P78412 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
IRX6P78412 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
IRX6P78412 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
IRX6P78412 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
IRX6P78412 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
IRX6P78412 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
IRX6P78412 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
IRX6P78412 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
IRX6P78412 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
IRX6P78412 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
IRX6P78412 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
IRX6P78412 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
IRX6P78412 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
IRX6P78412 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
IRX6P78412 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
IRX6P78412 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
IRX6P78412 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
IRX6P78412 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
IRX6P78412 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
IRX6P78412 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
IRX6P78412 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
IRX6P78412 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
IRX6P78412 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
IRX6P78412 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
IRX6P78412 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
IRX6P78412 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
IRX6P78412 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
IRX6P78412 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
IRX6P78412 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
IRX6P78412 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
IRX6P78412 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
IRX6P78412 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
IRX6P78412 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
IRX6P78412 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
IRX6P78412 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
IRX6P78412 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
IRX6P78412 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
IRX6P78412 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
IRX6P78412 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
IRX6P78412 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
IRX6P78412 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
IRX6P78412 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
IRX6P78412 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
IRX6P78412 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
IRX6P78412 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
IRX6P78412 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
IRX6P78412 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
IRX6P78412 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
IRX6P78412 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
IRX6P78412 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
IRX6P78412 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
IRX6P78412 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
IRX6P78412 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
IRX6P78412 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
IRX6P78412 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms