Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA6P60900 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMA6P60900 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMA6P60900 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMA6P60900 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMA6P60900 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMA6P60900 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMA6P60900 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMA6P60900 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMA6P60900 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMA6P60900 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMA6P60900 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMA6P60900 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMA6P60900 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMA6P60900 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMA6P60900 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMA6P60900 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMA6P60900 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMA6P60900 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMA6P60900 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMA6P60900 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMA6P60900 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMA6P60900 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMA6P60900 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMA6P60900 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMA6P60900 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMA6P60900 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMA6P60900 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMA6P60900 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMA6P60900 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMA6P60900 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMA6P60900 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMA6P60900 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMA6P60900 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMA6P60900 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMA6P60900 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMA6P60900 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMA6P60900 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMA6P60900 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMA6P60900 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMA6P60900 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMA6P60900 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMA6P60900 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMA6P60900 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMA6P60900 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMA6P60900 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMA6P60900 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMA6P60900 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMA6P60900 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMA6P60900 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMA6P60900 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMA6P60900 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMA6P60900 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMA6P60900 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMA6P60900 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMA6P60900 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMA6P60900 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMA6P60900 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMA6P60900 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMA6P60900 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMA6P60900 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMA6P60900 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA6P60900 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA6P60900 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA6P60900 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA6P60900 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA6P60900 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA6P60900 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMA6P60900 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMA6P60900 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMA6P60900 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMA6P60900 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMA6P60900 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMA6P60900 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMA6P60900 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMA6P60900 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMA6P60900 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMA6P60900 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMA6P60900 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMA6P60900 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMA6P60900 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA6P60900 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA6P60900 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA6P60900 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMA6P60900 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMA6P60900 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA6P60900 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMA6P60900 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA6P60900 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMA6P60900 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMA6P60900 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMA6P60900 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMA6P60900 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMA6P60900 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMA6P60900 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMA6P60900 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMA6P60900 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMA6P60900 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMA6P60900 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMA6P60900 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms