Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EEFSECP57772 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EEFSECP57772 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EEFSECP57772 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EEFSECP57772 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EEFSECP57772 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EEFSECP57772 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EEFSECP57772 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EEFSECP57772 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEFSECP57772 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EEFSECP57772 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEFSECP57772 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEFSECP57772 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEFSECP57772 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEFSECP57772 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EEFSECP57772 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EEFSECP57772 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EEFSECP57772 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEFSECP57772 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EEFSECP57772 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEFSECP57772 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EEFSECP57772 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEFSECP57772 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EEFSECP57772 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EEFSECP57772 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EEFSECP57772 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EEFSECP57772 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEFSECP57772 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
EEFSECP57772 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EEFSECP57772 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EEFSECP57772 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEFSECP57772 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEFSECP57772 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEFSECP57772 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EEFSECP57772 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EEFSECP57772 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EEFSECP57772 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EEFSECP57772 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EEFSECP57772 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EEFSECP57772 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EEFSECP57772 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEFSECP57772 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EEFSECP57772 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEFSECP57772 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EEFSECP57772 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EEFSECP57772 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EEFSECP57772 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEFSECP57772 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEFSECP57772 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEFSECP57772 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EEFSECP57772 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EEFSECP57772 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EEFSECP57772 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EEFSECP57772 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EEFSECP57772 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EEFSECP57772 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EEFSECP57772 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EEFSECP57772 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EEFSECP57772 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EEFSECP57772 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EEFSECP57772 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EEFSECP57772 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EEFSECP57772 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EEFSECP57772 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EEFSECP57772 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EEFSECP57772 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EEFSECP57772 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEFSECP57772 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
EEFSECP57772 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EEFSECP57772 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEFSECP57772 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEFSECP57772 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEFSECP57772 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEFSECP57772 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEFSECP57772 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEFSECP57772 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEFSECP57772 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEFSECP57772 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEFSECP57772 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEFSECP57772 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EEFSECP57772 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EEFSECP57772 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EEFSECP57772 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EEFSECP57772 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEFSECP57772 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEFSECP57772 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEFSECP57772 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEFSECP57772 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EEFSECP57772 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EEFSECP57772 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EEFSECP57772 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EEFSECP57772 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EEFSECP57772 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EEFSECP57772 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EEFSECP57772 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EEFSECP57772 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EEFSECP57772 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EEFSECP57772 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EEFSECP57772 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EEFSECP57772 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms