Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP1A2P50993 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP1A2P50993 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP1A2P50993 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP1A2P50993 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP1A2P50993 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP1A2P50993 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP1A2P50993 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP1A2P50993 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP1A2P50993 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP1A2P50993 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATP1A2P50993 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP1A2P50993 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP1A2P50993 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP1A2P50993 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP1A2P50993 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP1A2P50993 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP1A2P50993 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP1A2P50993 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP1A2P50993 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP1A2P50993 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP1A2P50993 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP1A2P50993 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP1A2P50993 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP1A2P50993 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP1A2P50993 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP1A2P50993 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP1A2P50993 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP1A2P50993 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP1A2P50993 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP1A2P50993 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP1A2P50993 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP1A2P50993 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP1A2P50993 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP1A2P50993 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP1A2P50993 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP1A2P50993 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP1A2P50993 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP1A2P50993 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP1A2P50993 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP1A2P50993 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP1A2P50993 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP1A2P50993 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP1A2P50993 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP1A2P50993 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP1A2P50993 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP1A2P50993 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP1A2P50993 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP1A2P50993 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP1A2P50993 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP1A2P50993 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP1A2P50993 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP1A2P50993 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP1A2P50993 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP1A2P50993 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP1A2P50993 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP1A2P50993 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP1A2P50993 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP1A2P50993 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP1A2P50993 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP1A2P50993 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP1A2P50993 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP1A2P50993 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP1A2P50993 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP1A2P50993 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP1A2P50993 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP1A2P50993 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP1A2P50993 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP1A2P50993 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP1A2P50993 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP1A2P50993 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP1A2P50993 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP1A2P50993 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP1A2P50993 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP1A2P50993 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP1A2P50993 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP1A2P50993 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP1A2P50993 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP1A2P50993 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP1A2P50993 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP1A2P50993 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP1A2P50993 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP1A2P50993 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP1A2P50993 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP1A2P50993 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP1A2P50993 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP1A2P50993 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP1A2P50993 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP1A2P50993 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP1A2P50993 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP1A2P50993 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP1A2P50993 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP1A2P50993 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP1A2P50993 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP1A2P50993 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP1A2P50993 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP1A2P50993 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP1A2P50993 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP1A2P50993 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP1A2P50993 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms