Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATP1A2P50993 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ATP1A2P50993 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP1A2P50993 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATP1A2P50993 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATP1A2P50993 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATP1A2P50993 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATP1A2P50993 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
ATP1A2P50993 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP1A2P50993 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP1A2P50993 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP1A2P50993 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP1A2P50993 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ATP1A2P50993 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATP1A2P50993 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATP1A2P50993 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ATP1A2P50993 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATP1A2P50993 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP1A2P50993 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP1A2P50993 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP1A2P50993 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP1A2P50993 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ATP1A2P50993 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
ATP1A2P50993 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATP1A2P50993 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP1A2P50993 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ATP1A2P50993 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATP1A2P50993 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATP1A2P50993 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ATP1A2P50993 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATP1A2P50993 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP1A2P50993 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP1A2P50993 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP1A2P50993 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP1A2P50993 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP1A2P50993 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP1A2P50993 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATP1A2P50993 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP1A2P50993 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP1A2P50993 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATP1A2P50993 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP1A2P50993 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP1A2P50993 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP1A2P50993 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP1A2P50993 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP1A2P50993 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP1A2P50993 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP1A2P50993 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP1A2P50993 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.49
ATP1A2P50993 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
ATP1A2P50993 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP1A2P50993 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP1A2P50993 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP1A2P50993 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATP1A2P50993 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP1A2P50993 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP1A2P50993 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP1A2P50993 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP1A2P50993 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATP1A2P50993 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATP1A2P50993 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATP1A2P50993 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP1A2P50993 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP1A2P50993 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP1A2P50993 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP1A2P50993 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP1A2P50993 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP1A2P50993 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP1A2P50993 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP1A2P50993 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP1A2P50993 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP1A2P50993 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP1A2P50993 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP1A2P50993 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP1A2P50993 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ATP1A2P50993 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP1A2P50993 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP1A2P50993 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP1A2P50993 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP1A2P50993 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP1A2P50993 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP1A2P50993 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP1A2P50993 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP1A2P50993 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP1A2P50993 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP1A2P50993 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP1A2P50993 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP1A2P50993 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP1A2P50993 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP1A2P50993 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP1A2P50993 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP1A2P50993 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP1A2P50993 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP1A2P50993 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP1A2P50993 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP1A2P50993 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP1A2P50993 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP1A2P50993 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP1A2P50993 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP1A2P50993 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms