Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC192P0DO97 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC192P0DO97 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCDC192P0DO97 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC192P0DO97 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC192P0DO97 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC192P0DO97 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC192P0DO97 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC192P0DO97 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC192P0DO97 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC192P0DO97 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC192P0DO97 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC192P0DO97 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC192P0DO97 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC192P0DO97 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC192P0DO97 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC192P0DO97 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC192P0DO97 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC192P0DO97 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC192P0DO97 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC192P0DO97 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC192P0DO97 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC192P0DO97 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC192P0DO97 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC192P0DO97 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC192P0DO97 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC192P0DO97 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC192P0DO97 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC192P0DO97 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC192P0DO97 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC192P0DO97 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC192P0DO97 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC192P0DO97 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC192P0DO97 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC192P0DO97 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC192P0DO97 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC192P0DO97 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC192P0DO97 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC192P0DO97 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC192P0DO97 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC192P0DO97 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC192P0DO97 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC192P0DO97 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC192P0DO97 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC192P0DO97 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC192P0DO97 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC192P0DO97 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC192P0DO97 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC192P0DO97 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC192P0DO97 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC192P0DO97 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC192P0DO97 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC192P0DO97 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC192P0DO97 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC192P0DO97 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC192P0DO97 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC192P0DO97 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CCDC192P0DO97 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC192P0DO97 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC192P0DO97 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC192P0DO97 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC192P0DO97 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC192P0DO97 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC192P0DO97 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC192P0DO97 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC192P0DO97 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC192P0DO97 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC192P0DO97 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC192P0DO97 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC192P0DO97 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC192P0DO97 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC192P0DO97 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC192P0DO97 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC192P0DO97 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC192P0DO97 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC192P0DO97 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC192P0DO97 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC192P0DO97 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC192P0DO97 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC192P0DO97 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC192P0DO97 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC192P0DO97 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CCDC192P0DO97 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC192P0DO97 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC192P0DO97 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC192P0DO97 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC192P0DO97 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC192P0DO97 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC192P0DO97 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC192P0DO97 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC192P0DO97 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC192P0DO97 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC192P0DO97 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC192P0DO97 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC192P0DO97 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC192P0DO97 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC192P0DO97 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC192P0DO97 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC192P0DO97 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC192P0DO97 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms