Protein–RNA interactions for Protein: P00439

PAH, Phenylalanine-4-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAHP00439 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAHP00439 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAHP00439 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAHP00439 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAHP00439 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAHP00439 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAHP00439 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAHP00439 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAHP00439 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAHP00439 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAHP00439 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAHP00439 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAHP00439 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAHP00439 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAHP00439 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAHP00439 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAHP00439 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAHP00439 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAHP00439 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAHP00439 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAHP00439 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAHP00439 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAHP00439 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAHP00439 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAHP00439 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAHP00439 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAHP00439 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAHP00439 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PAHP00439 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAHP00439 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAHP00439 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAHP00439 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAHP00439 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAHP00439 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAHP00439 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAHP00439 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAHP00439 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PAHP00439 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAHP00439 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAHP00439 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAHP00439 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAHP00439 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAHP00439 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAHP00439 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAHP00439 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAHP00439 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAHP00439 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAHP00439 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAHP00439 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAHP00439 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAHP00439 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAHP00439 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAHP00439 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAHP00439 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAHP00439 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAHP00439 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAHP00439 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAHP00439 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAHP00439 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAHP00439 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAHP00439 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAHP00439 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAHP00439 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAHP00439 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAHP00439 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAHP00439 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAHP00439 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAHP00439 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAHP00439 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAHP00439 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAHP00439 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAHP00439 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAHP00439 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAHP00439 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAHP00439 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAHP00439 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAHP00439 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAHP00439 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAHP00439 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAHP00439 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAHP00439 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAHP00439 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAHP00439 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAHP00439 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAHP00439 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAHP00439 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAHP00439 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAHP00439 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAHP00439 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PAHP00439 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAHP00439 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAHP00439 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAHP00439 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAHP00439 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAHP00439 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAHP00439 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAHP00439 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAHP00439 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAHP00439 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAHP00439 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms