Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSX5O60225 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX5O60225 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX5O60225 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX5O60225 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSX5O60225 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSX5O60225 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSX5O60225 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSX5O60225 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSX5O60225 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSX5O60225 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSX5O60225 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSX5O60225 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSX5O60225 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSX5O60225 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSX5O60225 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSX5O60225 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSX5O60225 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSX5O60225 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSX5O60225 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSX5O60225 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSX5O60225 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSX5O60225 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSX5O60225 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSX5O60225 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSX5O60225 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSX5O60225 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSX5O60225 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX5O60225 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX5O60225 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX5O60225 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSX5O60225 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSX5O60225 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSX5O60225 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX5O60225 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX5O60225 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX5O60225 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX5O60225 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX5O60225 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX5O60225 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX5O60225 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSX5O60225 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSX5O60225 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSX5O60225 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSX5O60225 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX5O60225 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX5O60225 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX5O60225 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX5O60225 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX5O60225 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX5O60225 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX5O60225 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX5O60225 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX5O60225 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX5O60225 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX5O60225 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX5O60225 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSX5O60225 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX5O60225 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSX5O60225 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSX5O60225 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSX5O60225 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSX5O60225 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX5O60225 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX5O60225 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX5O60225 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSX5O60225 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSX5O60225 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX5O60225 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX5O60225 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX5O60225 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX5O60225 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSX5O60225 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSX5O60225 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX5O60225 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX5O60225 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX5O60225 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX5O60225 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSX5O60225 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSX5O60225 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX5O60225 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX5O60225 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX5O60225 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX5O60225 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX5O60225 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SSX5O60225 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX5O60225 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX5O60225 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX5O60225 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX5O60225 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX5O60225 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX5O60225 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX5O60225 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX5O60225 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX5O60225 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX5O60225 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX5O60225 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX5O60225 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX5O60225 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX5O60225 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 529.6 ms