Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP8B1O43520 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATP8B1O43520 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATP8B1O43520 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP8B1O43520 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP8B1O43520 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP8B1O43520 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATP8B1O43520 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP8B1O43520 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP8B1O43520 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP8B1O43520 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP8B1O43520 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP8B1O43520 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP8B1O43520 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP8B1O43520 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP8B1O43520 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP8B1O43520 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP8B1O43520 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP8B1O43520 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP8B1O43520 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP8B1O43520 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP8B1O43520 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP8B1O43520 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP8B1O43520 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP8B1O43520 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP8B1O43520 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP8B1O43520 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP8B1O43520 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP8B1O43520 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP8B1O43520 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP8B1O43520 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP8B1O43520 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP8B1O43520 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP8B1O43520 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP8B1O43520 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP8B1O43520 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP8B1O43520 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP8B1O43520 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP8B1O43520 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP8B1O43520 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP8B1O43520 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP8B1O43520 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP8B1O43520 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP8B1O43520 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP8B1O43520 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP8B1O43520 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP8B1O43520 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP8B1O43520 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP8B1O43520 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP8B1O43520 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP8B1O43520 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP8B1O43520 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP8B1O43520 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP8B1O43520 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP8B1O43520 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP8B1O43520 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP8B1O43520 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP8B1O43520 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATP8B1O43520 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP8B1O43520 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP8B1O43520 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP8B1O43520 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP8B1O43520 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP8B1O43520 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP8B1O43520 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP8B1O43520 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP8B1O43520 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP8B1O43520 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP8B1O43520 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP8B1O43520 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP8B1O43520 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP8B1O43520 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP8B1O43520 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP8B1O43520 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP8B1O43520 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP8B1O43520 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP8B1O43520 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP8B1O43520 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP8B1O43520 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP8B1O43520 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP8B1O43520 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP8B1O43520 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP8B1O43520 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP8B1O43520 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP8B1O43520 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP8B1O43520 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP8B1O43520 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATP8B1O43520 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP8B1O43520 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP8B1O43520 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP8B1O43520 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP8B1O43520 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP8B1O43520 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP8B1O43520 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP8B1O43520 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP8B1O43520 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP8B1O43520 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP8B1O43520 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP8B1O43520 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP8B1O43520 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms