Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCP110O43303 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCP110O43303 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCP110O43303 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCP110O43303 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CCP110O43303 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCP110O43303 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCP110O43303 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCP110O43303 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCP110O43303 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCP110O43303 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCP110O43303 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCP110O43303 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCP110O43303 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCP110O43303 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCP110O43303 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CCP110O43303 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCP110O43303 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCP110O43303 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCP110O43303 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCP110O43303 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCP110O43303 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CCP110O43303 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCP110O43303 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCP110O43303 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCP110O43303 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCP110O43303 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCP110O43303 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCP110O43303 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCP110O43303 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCP110O43303 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCP110O43303 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCP110O43303 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCP110O43303 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCP110O43303 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCP110O43303 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCP110O43303 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCP110O43303 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCP110O43303 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCP110O43303 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCP110O43303 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCP110O43303 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCP110O43303 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCP110O43303 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CCP110O43303 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCP110O43303 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCP110O43303 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCP110O43303 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCP110O43303 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCP110O43303 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCP110O43303 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCP110O43303 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCP110O43303 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCP110O43303 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCP110O43303 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCP110O43303 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCP110O43303 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCP110O43303 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCP110O43303 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCP110O43303 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCP110O43303 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCP110O43303 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCP110O43303 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCP110O43303 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCP110O43303 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCP110O43303 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCP110O43303 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCP110O43303 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCP110O43303 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCP110O43303 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCP110O43303 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCP110O43303 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCP110O43303 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCP110O43303 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CCP110O43303 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCP110O43303 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCP110O43303 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCP110O43303 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCP110O43303 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCP110O43303 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CCP110O43303 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCP110O43303 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCP110O43303 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCP110O43303 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCP110O43303 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCP110O43303 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCP110O43303 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCP110O43303 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCP110O43303 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCP110O43303 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCP110O43303 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCP110O43303 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCP110O43303 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCP110O43303 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCP110O43303 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCP110O43303 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCP110O43303 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCP110O43303 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCP110O43303 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCP110O43303 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms