Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCYO14598 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCYO14598 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCYO14598 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCYO14598 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VCYO14598 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCYO14598 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCYO14598 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCYO14598 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCYO14598 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCYO14598 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCYO14598 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCYO14598 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCYO14598 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCYO14598 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCYO14598 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCYO14598 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCYO14598 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCYO14598 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCYO14598 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCYO14598 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCYO14598 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VCYO14598 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VCYO14598 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VCYO14598 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VCYO14598 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VCYO14598 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCYO14598 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCYO14598 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCYO14598 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCYO14598 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCYO14598 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCYO14598 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VCYO14598 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VCYO14598 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCYO14598 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCYO14598 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCYO14598 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCYO14598 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCYO14598 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCYO14598 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VCYO14598 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VCYO14598 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCYO14598 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VCYO14598 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCYO14598 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCYO14598 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCYO14598 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCYO14598 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCYO14598 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCYO14598 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCYO14598 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VCYO14598 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCYO14598 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCYO14598 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCYO14598 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCYO14598 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCYO14598 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCYO14598 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCYO14598 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCYO14598 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCYO14598 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCYO14598 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCYO14598 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCYO14598 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCYO14598 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCYO14598 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCYO14598 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCYO14598 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VCYO14598 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCYO14598 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VCYO14598 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCYO14598 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCYO14598 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCYO14598 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCYO14598 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCYO14598 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCYO14598 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCYO14598 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCYO14598 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCYO14598 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCYO14598 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCYO14598 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCYO14598 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCYO14598 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VCYO14598 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCYO14598 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCYO14598 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCYO14598 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VCYO14598 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VCYO14598 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VCYO14598 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VCYO14598 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VCYO14598 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VCYO14598 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VCYO14598 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VCYO14598 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VCYO14598 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VCYO14598 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VCYO14598 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms