Protein–RNA interactions for Protein: A8MVA2

KRTAP9-6, Keratin-associated protein 9-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-6A8MVA2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP9-6A8MVA2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-6A8MVA2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP9-6A8MVA2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-6A8MVA2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-6A8MVA2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-6A8MVA2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-6A8MVA2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-6A8MVA2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-6A8MVA2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-6A8MVA2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-6A8MVA2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-6A8MVA2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP9-6A8MVA2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP9-6A8MVA2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP9-6A8MVA2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP9-6A8MVA2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP9-6A8MVA2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-6A8MVA2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-6A8MVA2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-6A8MVA2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-6A8MVA2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-6A8MVA2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-6A8MVA2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-6A8MVA2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-6A8MVA2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-6A8MVA2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-6A8MVA2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP9-6A8MVA2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP9-6A8MVA2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP9-6A8MVA2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-6A8MVA2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP9-6A8MVA2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms