Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD0

IFITM10, Interferon-induced transmembrane protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM10A6NMD0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFITM10A6NMD0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFITM10A6NMD0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFITM10A6NMD0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFITM10A6NMD0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFITM10A6NMD0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFITM10A6NMD0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFITM10A6NMD0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFITM10A6NMD0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFITM10A6NMD0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFITM10A6NMD0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFITM10A6NMD0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFITM10A6NMD0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFITM10A6NMD0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFITM10A6NMD0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFITM10A6NMD0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFITM10A6NMD0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFITM10A6NMD0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFITM10A6NMD0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFITM10A6NMD0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFITM10A6NMD0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFITM10A6NMD0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFITM10A6NMD0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFITM10A6NMD0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFITM10A6NMD0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFITM10A6NMD0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFITM10A6NMD0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFITM10A6NMD0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFITM10A6NMD0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFITM10A6NMD0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFITM10A6NMD0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFITM10A6NMD0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFITM10A6NMD0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFITM10A6NMD0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFITM10A6NMD0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFITM10A6NMD0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFITM10A6NMD0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFITM10A6NMD0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFITM10A6NMD0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFITM10A6NMD0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFITM10A6NMD0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFITM10A6NMD0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFITM10A6NMD0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
IFITM10A6NMD0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFITM10A6NMD0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFITM10A6NMD0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFITM10A6NMD0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFITM10A6NMD0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFITM10A6NMD0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFITM10A6NMD0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFITM10A6NMD0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFITM10A6NMD0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFITM10A6NMD0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFITM10A6NMD0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFITM10A6NMD0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFITM10A6NMD0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFITM10A6NMD0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFITM10A6NMD0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFITM10A6NMD0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFITM10A6NMD0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFITM10A6NMD0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFITM10A6NMD0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IFITM10A6NMD0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFITM10A6NMD0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFITM10A6NMD0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFITM10A6NMD0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFITM10A6NMD0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFITM10A6NMD0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFITM10A6NMD0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFITM10A6NMD0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFITM10A6NMD0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFITM10A6NMD0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFITM10A6NMD0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFITM10A6NMD0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFITM10A6NMD0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFITM10A6NMD0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IFITM10A6NMD0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFITM10A6NMD0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFITM10A6NMD0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFITM10A6NMD0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFITM10A6NMD0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFITM10A6NMD0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFITM10A6NMD0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFITM10A6NMD0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFITM10A6NMD0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFITM10A6NMD0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFITM10A6NMD0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IFITM10A6NMD0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFITM10A6NMD0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFITM10A6NMD0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFITM10A6NMD0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFITM10A6NMD0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFITM10A6NMD0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFITM10A6NMD0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFITM10A6NMD0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFITM10A6NMD0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFITM10A6NMD0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFITM10A6NMD0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFITM10A6NMD0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFITM10A6NMD0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms