Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAC3D1A6NKF1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAC3D1A6NKF1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SAC3D1A6NKF1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAC3D1A6NKF1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAC3D1A6NKF1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SAC3D1A6NKF1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SAC3D1A6NKF1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAC3D1A6NKF1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SAC3D1A6NKF1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SAC3D1A6NKF1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SAC3D1A6NKF1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SAC3D1A6NKF1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SAC3D1A6NKF1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SAC3D1A6NKF1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SAC3D1A6NKF1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAC3D1A6NKF1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SAC3D1A6NKF1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAC3D1A6NKF1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAC3D1A6NKF1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SAC3D1A6NKF1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SAC3D1A6NKF1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SAC3D1A6NKF1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SAC3D1A6NKF1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SAC3D1A6NKF1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAC3D1A6NKF1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAC3D1A6NKF1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAC3D1A6NKF1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAC3D1A6NKF1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAC3D1A6NKF1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAC3D1A6NKF1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAC3D1A6NKF1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAC3D1A6NKF1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAC3D1A6NKF1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAC3D1A6NKF1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAC3D1A6NKF1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAC3D1A6NKF1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAC3D1A6NKF1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAC3D1A6NKF1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAC3D1A6NKF1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAC3D1A6NKF1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAC3D1A6NKF1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SAC3D1A6NKF1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SAC3D1A6NKF1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SAC3D1A6NKF1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SAC3D1A6NKF1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAC3D1A6NKF1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAC3D1A6NKF1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAC3D1A6NKF1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAC3D1A6NKF1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAC3D1A6NKF1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAC3D1A6NKF1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAC3D1A6NKF1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAC3D1A6NKF1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAC3D1A6NKF1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAC3D1A6NKF1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAC3D1A6NKF1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAC3D1A6NKF1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAC3D1A6NKF1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAC3D1A6NKF1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAC3D1A6NKF1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAC3D1A6NKF1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAC3D1A6NKF1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SAC3D1A6NKF1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAC3D1A6NKF1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAC3D1A6NKF1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAC3D1A6NKF1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAC3D1A6NKF1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAC3D1A6NKF1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAC3D1A6NKF1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAC3D1A6NKF1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAC3D1A6NKF1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAC3D1A6NKF1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SAC3D1A6NKF1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAC3D1A6NKF1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAC3D1A6NKF1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAC3D1A6NKF1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAC3D1A6NKF1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAC3D1A6NKF1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAC3D1A6NKF1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAC3D1A6NKF1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAC3D1A6NKF1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAC3D1A6NKF1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAC3D1A6NKF1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAC3D1A6NKF1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAC3D1A6NKF1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAC3D1A6NKF1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAC3D1A6NKF1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAC3D1A6NKF1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAC3D1A6NKF1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAC3D1A6NKF1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAC3D1A6NKF1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SAC3D1A6NKF1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SAC3D1A6NKF1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAC3D1A6NKF1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAC3D1A6NKF1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAC3D1A6NKF1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SAC3D1A6NKF1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAC3D1A6NKF1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAC3D1A6NKF1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
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