Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SAC3D1A6NKF1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SAC3D1A6NKF1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SAC3D1A6NKF1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SAC3D1A6NKF1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SAC3D1A6NKF1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SAC3D1A6NKF1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SAC3D1A6NKF1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SAC3D1A6NKF1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SAC3D1A6NKF1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SAC3D1A6NKF1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SAC3D1A6NKF1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SAC3D1A6NKF1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SAC3D1A6NKF1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SAC3D1A6NKF1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SAC3D1A6NKF1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SAC3D1A6NKF1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SAC3D1A6NKF1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SAC3D1A6NKF1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SAC3D1A6NKF1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SAC3D1A6NKF1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SAC3D1A6NKF1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SAC3D1A6NKF1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SAC3D1A6NKF1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SAC3D1A6NKF1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SAC3D1A6NKF1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SAC3D1A6NKF1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SAC3D1A6NKF1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SAC3D1A6NKF1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAC3D1A6NKF1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAC3D1A6NKF1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SAC3D1A6NKF1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SAC3D1A6NKF1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SAC3D1A6NKF1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAC3D1A6NKF1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAC3D1A6NKF1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAC3D1A6NKF1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAC3D1A6NKF1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAC3D1A6NKF1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAC3D1A6NKF1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAC3D1A6NKF1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAC3D1A6NKF1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAC3D1A6NKF1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAC3D1A6NKF1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAC3D1A6NKF1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAC3D1A6NKF1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAC3D1A6NKF1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAC3D1A6NKF1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SAC3D1A6NKF1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SAC3D1A6NKF1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAC3D1A6NKF1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SAC3D1A6NKF1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SAC3D1A6NKF1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAC3D1A6NKF1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAC3D1A6NKF1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAC3D1A6NKF1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAC3D1A6NKF1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SAC3D1A6NKF1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SAC3D1A6NKF1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SAC3D1A6NKF1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAC3D1A6NKF1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAC3D1A6NKF1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SAC3D1A6NKF1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SAC3D1A6NKF1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAC3D1A6NKF1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAC3D1A6NKF1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAC3D1A6NKF1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SAC3D1A6NKF1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAC3D1A6NKF1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAC3D1A6NKF1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAC3D1A6NKF1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAC3D1A6NKF1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAC3D1A6NKF1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAC3D1A6NKF1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SAC3D1A6NKF1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SAC3D1A6NKF1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SAC3D1A6NKF1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SAC3D1A6NKF1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAC3D1A6NKF1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAC3D1A6NKF1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAC3D1A6NKF1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAC3D1A6NKF1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAC3D1A6NKF1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAC3D1A6NKF1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAC3D1A6NKF1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAC3D1A6NKF1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAC3D1A6NKF1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAC3D1A6NKF1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAC3D1A6NKF1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAC3D1A6NKF1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAC3D1A6NKF1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAC3D1A6NKF1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAC3D1A6NKF1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAC3D1A6NKF1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAC3D1A6NKF1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAC3D1A6NKF1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAC3D1A6NKF1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAC3D1A6NKF1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAC3D1A6NKF1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAC3D1A6NKF1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
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