Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.483e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.463e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 CTNNA1-206ENST00000517980 696 ntTSL 417.66■□□□□ 0.423e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 RANBP10-203ENST00000602506 2756 ntTSL 217.19■□□□□ 0.343e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.073e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.063e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.033e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.093e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SERTAD3-205ENST00000601217 398 ntTSL 314.38□□□□□ -0.113e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.133e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.133e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.393e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SERTAD3-202ENST00000392028 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 CTNNA1-211ENST00000518910 572 ntTSL 412□□□□□ -0.493e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 HCG18-236ENST00000438412 2440 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.493e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 CTNNA1-234ENST00000522227 642 ntTSL 311.9□□□□□ -0.53e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SMPD4P1-201ENST00000416717 2263 ntBASIC9.91□□□□□ -0.823e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 ZMYM2-209ENST00000494061 1063 ntTSL 29.49□□□□□ -0.893e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 CTNNA1-221ENST00000520339 868 ntTSL 39.43□□□□□ -0.93e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SUZ12P1-206ENST00000582557 1560 ntTSL 1 (best)9.1□□□□□ -0.953e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 HCG18-240ENST00000454269 2430 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.963e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 CTNNA1-240ENST00000523912 545 ntTSL 48.98□□□□□ -0.973e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 CTNNA1-215ENST00000519309 869 ntTSL 38.84□□□□□ -0.993e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.013e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 HCG18-234ENST00000413358 916 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.043e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.083e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 CTNNA1-231ENST00000521941 224 ntTSL 38.28□□□□□ -1.083e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.213e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 ABHD5-202ENST00000413300 525 ntTSL 36.97□□□□□ -1.293e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 ERBIN-211ENST00000507490 337 ntTSL 36.96□□□□□ -1.33e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.373e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.383e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 TBC1D5-230ENST00000507877 578 ntTSL 46.29□□□□□ -1.43e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.463e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 CTNNA1-219ENST00000520158 719 ntTSL 35.77□□□□□ -1.493e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.493e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 CTNNA1-241ENST00000524127 483 ntTSL 44.81□□□□□ -1.643e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.653e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 ZMYM2-205ENST00000382883 5445 ntTSL 54.11□□□□□ -1.753e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 FBXO11-208ENST00000480038 600 ntTSL 44.08□□□□□ -1.763e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 TBC1D5-213ENST00000434420 386 ntTSL 43.62□□□□□ -1.833e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.833e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.953e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 ZMYM2-201ENST00000382870 3456 ntTSL 1 (best)2.03□□□□□ -2.083e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.073e-12■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.013e-12■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 PPA1-201ENST00000373230 787 ntTSL 57.06□□□□□ -1.283e-12■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.141e-7■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.522e-15■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SSR1-205ENST00000475213 446 ntTSL 312.32□□□□□ -0.442e-15■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.182e-15■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.262e-15■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.622e-15■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 ANKRD27-208ENST00000591100 628 ntTSL 56.15□□□□□ -1.422e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SFT2D2-203ENST00000471981 666 ntTSL 525.24■■□□□ 1.636e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.086e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.076e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SMG7-205ENST00000440812 1190 ntTSL 521.36■■□□□ 1.016e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.016e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 TMEM50B-204ENST00000442441 982 ntTSL 1 (best)21.21■□□□□ 0.996e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.946e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.856e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 RANBP1-213ENST00000486575 2177 ntTSL 220.1■□□□□ 0.816e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SMG7-203ENST00000367538 328 ntTSL 219.16■□□□□ 0.666e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SMG7-206ENST00000444547 580 ntTSL 418.79■□□□□ 0.66e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.536e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SMG7-213ENST00000507691 760 ntTSL 517.71■□□□□ 0.436e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 TMEM50B-205ENST00000459909 618 ntTSL 217.41■□□□□ 0.386e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 LIN28B-202ENST00000635857 912 ntTSL 516.8■□□□□ 0.286e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SMG7-204ENST00000419169 2483 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.56■□□□□ 0.246e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.166e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.136e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SEC14L1-216ENST00000587820 652 ntTSL 315.35■□□□□ 0.056e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.036e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SMG7-210ENST00000502375 566 ntTSL 514.64□□□□□ -0.076e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 MICAL3-213ENST00000577821 807 ntTSL 314.43□□□□□ -0.16e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 RAB28-205ENST00000508274 1551 ntTSL 1 (best)14.41□□□□□ -0.16e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.256e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 MICAL3-216ENST00000579997 519 ntTSL 512.62□□□□□ -0.396e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.426e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.436e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-13■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 CCNY-210ENST00000497692 478 ntTSL 211.15□□□□□ -0.626e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.632e-13■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SEC14L1-212ENST00000585618 2712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.656e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 CTSC-207ENST00000533865 542 ntTSL 411.01□□□□□ -0.656e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 MICAL3-217ENST00000580469 3622 ntTSL 410.96□□□□□ -0.656e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 CTSC-204ENST00000527018 733 ntTSL 510.89□□□□□ -0.676e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SEC14L1-227ENST00000591437 2828 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.76e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 AC016026.1-201ENST00000476405 4328 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.726e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 CTSC-201ENST00000227266 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.726e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 ERGIC1-211ENST00000523215 3621 ntTSL 1 (best)9.88□□□□□ -0.836e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 CCNY-205ENST00000465416 432 ntTSL 59.7□□□□□ -0.866e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 NFYA-201ENST00000341376 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.886e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.036e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SEC14L1-214ENST00000586429 575 ntTSL 58.35□□□□□ -1.076e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.26e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SEC14L1-213ENST00000586390 566 ntTSL 46.96□□□□□ -1.36e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 RAB28-207ENST00000511649 715 ntTSL 56.55□□□□□ -1.366e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 RAB28-204ENST00000504644 405 ntTSL 56.54□□□□□ -1.366e-6■■□□□ 11.6
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