RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.03■■■□□ 2.56
HCG18-241ENST00000602290 ABCC9O60706 1549 aa29.42■■■□□ 2.3
HCG18-241ENST00000602290 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.66■■■□□ 2.18
HCG18-241ENST00000602290 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.4■■■□□ 2.14
HCG18-241ENST00000602290 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.52■■■□□ 2
HCG18-241ENST00000602290 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.15■■□□□ 1.94
HCG18-241ENST00000602290 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
HCG18-241ENST00000602290 NACADO15069 1562 aa27.08■■□□□ 1.93
HCG18-241ENST00000602290 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.92■■□□□ 1.9
HCG18-241ENST00000602290 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.88■■□□□ 1.89
HCG18-241ENST00000602290 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.66■■□□□ 1.86
HCG18-241ENST00000602290 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.57■■□□□ 1.84
HCG18-241ENST00000602290 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.43■■□□□ 1.82
HCG18-241ENST00000602290 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.43■■□□□ 1.82
HCG18-241ENST00000602290 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.31■■□□□ 1.8
HCG18-241ENST00000602290 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
HCG18-241ENST00000602290 CUX2O14529 1486 aa25.92■■□□□ 1.74
HCG18-241ENST00000602290 SCRIBQ14160 1630 aa25.71■■□□□ 1.71
HCG18-241ENST00000602290 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.63■■□□□ 1.69
HCG18-241ENST00000602290 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
HCG18-241ENST00000602290 ERCC6Q03468 1493 aa25.44■■□□□ 1.66
HCG18-241ENST00000602290 TRIM41Q8WV44 630 aa25.32■■□□□ 1.64
HCG18-241ENST00000602290 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HCG18-241ENST00000602290 NCAPD3P42695 1498 aa25.03■■□□□ 1.6
HCG18-241ENST00000602290 NESP48681 1621 aa24.97■■□□□ 1.59
HCG18-241ENST00000602290 HMGXB3Q12766 1538 aa24.79■■□□□ 1.56
HCG18-241ENST00000602290 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.78■■□□□ 1.56
HCG18-241ENST00000602290 SMARCA2P51531 1590 aa24.71■■□□□ 1.55
HCG18-241ENST00000602290 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.64■■□□□ 1.54
HCG18-241ENST00000602290 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.62■■□□□ 1.53
HCG18-241ENST00000602290 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HCG18-241ENST00000602290 SMARCA4P51532 1647 aa24.46■■□□□ 1.51
HCG18-241ENST00000602290 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.46■■□□□ 1.51
HCG18-241ENST00000602290 WDR62O43379 1518 aa24.44■■□□□ 1.5
HCG18-241ENST00000602290 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
HCG18-241ENST00000602290 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.39■■□□□ 1.5
HCG18-241ENST00000602290 OSCARQ8IYS5 282 aa24.35■■□□□ 1.49
HCG18-241ENST00000602290 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.33■■□□□ 1.49
HCG18-241ENST00000602290 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.33■■□□□ 1.49
HCG18-241ENST00000602290 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.33■■□□□ 1.49
HCG18-241ENST00000602290 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.32■■□□□ 1.48
HCG18-241ENST00000602290 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.16■■□□□ 1.46
HCG18-241ENST00000602290 ARHGEF11O15085 1522 aa24.15■■□□□ 1.46
HCG18-241ENST00000602290 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.03■■□□□ 1.44
HCG18-241ENST00000602290 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
HCG18-241ENST00000602290 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.89■■□□□ 1.42
HCG18-241ENST00000602290 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.89■■□□□ 1.41
HCG18-241ENST00000602290 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
HCG18-241ENST00000602290 ARAP1Q96P48 1450 aa23.86■■□□□ 1.41
HCG18-241ENST00000602290 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.83■■□□□ 1.41
HCG18-241ENST00000602290 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
HCG18-241ENST00000602290 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
HCG18-241ENST00000602290 CFTRP13569 1480 aa23.7■■□□□ 1.38
HCG18-241ENST00000602290 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HCG18-241ENST00000602290 IFT140Q96RY7 1462 aa23.61■■□□□ 1.37
HCG18-241ENST00000602290 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HCG18-241ENST00000602290 CHD1O14646 1710 aa23.53■■□□□ 1.36
HCG18-241ENST00000602290 WIZO95785 1651 aa23.5■■□□□ 1.35
HCG18-241ENST00000602290 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.34■■□□□ 1.33
HCG18-241ENST00000602290 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HCG18-241ENST00000602290 TOPBP1Q92547 1522 aa23.33■■□□□ 1.33
HCG18-241ENST00000602290 PRDM2Q13029 1718 aa23.33■■□□□ 1.32
HCG18-241ENST00000602290 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
HCG18-241ENST00000602290 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HCG18-241ENST00000602290 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
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HCG18-241ENST00000602290 FBLN2P98095 1184 aa23.16■■□□□ 1.3
HCG18-241ENST00000602290 ABCC8Q09428 1581 aa23.14■■□□□ 1.3
HCG18-241ENST00000602290 SYNJ1O43426 1573 aa23.1■■□□□ 1.29
HCG18-241ENST00000602290 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.08■■□□□ 1.29
HCG18-241ENST00000602290 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.05■■□□□ 1.28
HCG18-241ENST00000602290 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HCG18-241ENST00000602290 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HCG18-241ENST00000602290 WDR97A6NE52 1622 aa22.96■■□□□ 1.27
HCG18-241ENST00000602290 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.92■■□□□ 1.26
HCG18-241ENST00000602290 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HCG18-241ENST00000602290 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.9■■□□□ 1.26
HCG18-241ENST00000602290 SYNJ2O15056 1496 aa22.89■■□□□ 1.25
HCG18-241ENST00000602290 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.88■■□□□ 1.25
HCG18-241ENST00000602290 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.86■■□□□ 1.25
HCG18-241ENST00000602290 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HCG18-241ENST00000602290 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.84■■□□□ 1.25
HCG18-241ENST00000602290 GRIN2BQ13224 1484 aa22.8■■□□□ 1.24
HCG18-241ENST00000602290 SOGA1O94964 1423 aa22.8■■□□□ 1.24
HCG18-241ENST00000602290 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.69■■□□□ 1.22
HCG18-241ENST00000602290 CEP170Q5SW79 1584 aa22.67■■□□□ 1.22
HCG18-241ENST00000602290 PBRM1Q86U86 1689 aa22.64■■□□□ 1.21
HCG18-241ENST00000602290 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.63■■□□□ 1.21
HCG18-241ENST00000602290 SHROOM2Q13796 1616 aa22.61■■□□□ 1.21
HCG18-241ENST00000602290 KDM6BO15054 1643 aa22.6■■□□□ 1.21
HCG18-241ENST00000602290 DIP2BQ9P265 1576 aa22.58■■□□□ 1.2
HCG18-241ENST00000602290 NUP160Q12769 1436 aa22.57■■□□□ 1.2
HCG18-241ENST00000602290 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.56■■□□□ 1.2
HCG18-241ENST00000602290 GRIN2AQ12879 1464 aa22.54■■□□□ 1.2
HCG18-241ENST00000602290 MAPKBP1O60336 1514 aa22.53■■□□□ 1.2
HCG18-241ENST00000602290 CUX1P39880 1505 aa22.52■■□□□ 1.2
HCG18-241ENST00000602290 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.52■■□□□ 1.2
HCG18-241ENST00000602290 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.49■■□□□ 1.19
HCG18-241ENST00000602290 ADGRL1O94910 1474 aa22.47■■□□□ 1.19
HCG18-241ENST00000602290 ADAMTS12P58397 1594 aa22.43■■□□□ 1.18
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