RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373232.7

PPA1-202, Transcript of pyrophosphatase (inorganic) 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPA1, Length 1,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPA1-202ENST00000373232 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.11■■■■■ 6.09
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PPA1-202ENST00000373232 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.79■■■■■ 5.24
PPA1-202ENST00000373232 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.6■■■■■ 4.89
PPA1-202ENST00000373232 NACADO15069 1562 aa45.24■■■■■ 4.83
PPA1-202ENST00000373232 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.18■■■■■ 4.82
PPA1-202ENST00000373232 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.93■■■■■ 4.78
PPA1-202ENST00000373232 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.6■■■■■ 4.73
PPA1-202ENST00000373232 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.58■■■■■ 4.73
PPA1-202ENST00000373232 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.55■■■■■ 4.72
PPA1-202ENST00000373232 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.23■■■■■ 4.67
PPA1-202ENST00000373232 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
PPA1-202ENST00000373232 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.89■■■■■ 4.62
PPA1-202ENST00000373232 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.66■■■■■ 4.58
PPA1-202ENST00000373232 SCRIBQ14160 1630 aa43.46■■■■■ 4.55
PPA1-202ENST00000373232 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.33■■■■■ 4.53
PPA1-202ENST00000373232 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.24■■■■■ 4.51
PPA1-202ENST00000373232 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
PPA1-202ENST00000373232 NCAPD3P42695 1498 aa41.75■■■■■ 4.27
PPA1-202ENST00000373232 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.71■■■■■ 4.27
PPA1-202ENST00000373232 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.57■■■■■ 4.25
PPA1-202ENST00000373232 SMARCA2P51531 1590 aa41.47■■■■■ 4.23
PPA1-202ENST00000373232 SMARCA4P51532 1647 aa41.47■■■■■ 4.23
PPA1-202ENST00000373232 CUX2O14529 1486 aa41.47■■■■■ 4.23
PPA1-202ENST00000373232 ERCC6Q03468 1493 aa41.44■■■■■ 4.22
PPA1-202ENST00000373232 HMGXB3Q12766 1538 aa41.41■■■■■ 4.22
PPA1-202ENST00000373232 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
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PPA1-202ENST00000373232 NESP48681 1621 aa41.11■■■■■ 4.17
PPA1-202ENST00000373232 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.09■■■■■ 4.17
PPA1-202ENST00000373232 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.89■■■■■ 4.14
PPA1-202ENST00000373232 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.86■■■■■ 4.13
PPA1-202ENST00000373232 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
PPA1-202ENST00000373232 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.63■■■■■ 4.09
PPA1-202ENST00000373232 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.62■■■■■ 4.09
PPA1-202ENST00000373232 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.47■■■■■ 4.07
PPA1-202ENST00000373232 WIZO95785 1651 aa40.4■■■■■ 4.06
PPA1-202ENST00000373232 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.26■■■■■ 4.03
PPA1-202ENST00000373232 WDR62O43379 1518 aa40.16■■■■■ 4.02
PPA1-202ENST00000373232 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.06■■■■■ 4
PPA1-202ENST00000373232 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.99■■■■□ 3.99
PPA1-202ENST00000373232 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
PPA1-202ENST00000373232 CFTRP13569 1480 aa39.95■■■■□ 3.99
PPA1-202ENST00000373232 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
PPA1-202ENST00000373232 TRIM41Q8WV44 630 aa39.74■■■■□ 3.95
PPA1-202ENST00000373232 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
PPA1-202ENST00000373232 PRDM2Q13029 1718 aa39.6■■■■□ 3.93
PPA1-202ENST00000373232 OSCARQ8IYS5 282 aa39.56■■■■□ 3.92
PPA1-202ENST00000373232 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.43■■■■□ 3.9
PPA1-202ENST00000373232 IFT140Q96RY7 1462 aa39.28■■■■□ 3.88
PPA1-202ENST00000373232 TOPBP1Q92547 1522 aa39.2■■■■□ 3.87
PPA1-202ENST00000373232 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
PPA1-202ENST00000373232 ABCC8Q09428 1581 aa39.18■■■■□ 3.86
PPA1-202ENST00000373232 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.05■■■■□ 3.84
PPA1-202ENST00000373232 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.03■■■■□ 3.84
PPA1-202ENST00000373232 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.03■■■■□ 3.84
PPA1-202ENST00000373232 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.03■■■■□ 3.84
PPA1-202ENST00000373232 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
PPA1-202ENST00000373232 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
PPA1-202ENST00000373232 ARHGEF11O15085 1522 aa38.87■■■■□ 3.81
PPA1-202ENST00000373232 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.84■■■■□ 3.811e-7■■■■■ 32.3
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PPA1-202ENST00000373232 CHD1O14646 1710 aa38.77■■■■□ 3.8
PPA1-202ENST00000373232 FBLN2P98095 1184 aa38.65■■■■□ 3.78
PPA1-202ENST00000373232 SOGA1O94964 1423 aa38.63■■■■□ 3.78
PPA1-202ENST00000373232 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.63■■■■□ 3.77
PPA1-202ENST00000373232 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.62■■■■□ 3.77
PPA1-202ENST00000373232 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
PPA1-202ENST00000373232 WDR97A6NE52 1622 aa38.52■■■■□ 3.76
PPA1-202ENST00000373232 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.5■■■■□ 3.75
PPA1-202ENST00000373232 ARAP1Q96P48 1450 aa38.45■■■■□ 3.75
PPA1-202ENST00000373232 CUX1P39880 1505 aa38.43■■■■□ 3.74
PPA1-202ENST00000373232 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.41■■■■□ 3.74
PPA1-202ENST00000373232 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.35■■■■□ 3.73
PPA1-202ENST00000373232 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.35■■■■□ 3.73
PPA1-202ENST00000373232 GRIN2BQ13224 1484 aa38.32■■■■□ 3.72
PPA1-202ENST00000373232 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.29■■■■□ 3.72
PPA1-202ENST00000373232 SYNJ1O43426 1573 aa38.29■■■■□ 3.72
PPA1-202ENST00000373232 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
PPA1-202ENST00000373232 SYNJ2O15056 1496 aa38.22■■■■□ 3.71
PPA1-202ENST00000373232 PBRM1Q86U86 1689 aa38.17■■■■□ 3.7
PPA1-202ENST00000373232 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.15■■■■□ 3.7
PPA1-202ENST00000373232 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.08■■■■□ 3.69
PPA1-202ENST00000373232 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.03■■■■□ 3.68
PPA1-202ENST00000373232 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
PPA1-202ENST00000373232 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.88■■■■□ 3.66
PPA1-202ENST00000373232 GRIN2AQ12879 1464 aa37.81■■■■□ 3.64
PPA1-202ENST00000373232 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.79■■■■□ 3.64
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PPA1-202ENST00000373232 ADAMTS12P58397 1594 aa37.75■■■■□ 3.63
PPA1-202ENST00000373232 NUP160Q12769 1436 aa37.7■■■■□ 3.62
PPA1-202ENST00000373232 CEP170Q5SW79 1584 aa37.68■■■■□ 3.62
PPA1-202ENST00000373232 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.66■■■■□ 3.62
PPA1-202ENST00000373232 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.65■■■■□ 3.62
PPA1-202ENST00000373232 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.61■■■■□ 3.61
PPA1-202ENST00000373232 SHROOM2Q13796 1616 aa37.58■■■■□ 3.61
PPA1-202ENST00000373232 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
PPA1-202ENST00000373232 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
PPA1-202ENST00000373232 JPH4Q96JJ6 628 aa37.35■■■■□ 3.57
PPA1-202ENST00000373232 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.21■■■■□ 3.55
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