Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF648Q5T619 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF648Q5T619 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF648Q5T619 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF648Q5T619 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF648Q5T619 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms