RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540737.5

C11orf80-218, Transcript of chromosome 11 open reading frame 80, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene C11orf80, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf80-218ENST00000540737 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.7■■■■■ 6.67
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C11orf80-218ENST00000540737 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.43■■■■■ 5.02
C11orf80-218ENST00000540737 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.39■■■■■ 5.02
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C11orf80-218ENST00000540737 SCRIBQ14160 1630 aa45.22■■■■■ 4.83
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C11orf80-218ENST00000540737 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.35■■■■■ 4.21
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C11orf80-218ENST00000540737 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.24■■■■■ 4.19
C11orf80-218ENST00000540737 EEA1Q15075 1411 aa41.23■■■■■ 4.19
C11orf80-218ENST00000540737 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
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C11orf80-218ENST00000540737 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.81■■■■■ 4.12
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C11orf80-218ENST00000540737 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.19■■■■□ 3.86
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