RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383490.2

TMEM200C-201, Transcript of transmembrane protein 200C, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TMEM200C, Length 1,920 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200C-201ENST00000383490 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.94■■■■■ 6.87
TMEM200C-201ENST00000383490 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.77■■■■■ 5.72
TMEM200C-201ENST00000383490 ABCC9O60706 1549 aa48.83■■■■■ 5.41
TMEM200C-201ENST00000383490 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.5■■■■■ 5.36
TMEM200C-201ENST00000383490 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.2■■■■■ 5.31
TMEM200C-201ENST00000383490 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.84■■■■■ 5.25
TMEM200C-201ENST00000383490 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.56■■■■■ 5.2
TMEM200C-201ENST00000383490 NACADO15069 1562 aa47.51■■■■■ 5.2
TMEM200C-201ENST00000383490 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.29■■■■■ 5.16
TMEM200C-201ENST00000383490 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.83■■■■■ 5.09
TMEM200C-201ENST00000383490 SCRIBQ14160 1630 aa46.68■■■■■ 5.06
TMEM200C-201ENST00000383490 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.27■■■■■ 5
TMEM200C-201ENST00000383490 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.96■■■■■ 4.95
TMEM200C-201ENST00000383490 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.92■■■■■ 4.94
TMEM200C-201ENST00000383490 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.14■■■■■ 4.82
TMEM200C-201ENST00000383490 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.76■■■■■ 4.76
TMEM200C-201ENST00000383490 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
TMEM200C-201ENST00000383490 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.71■■■■■ 4.75
TMEM200C-201ENST00000383490 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.7■■■■■ 4.75
TMEM200C-201ENST00000383490 SMARCA4P51532 1647 aa44.67■■■■■ 4.74
TMEM200C-201ENST00000383490 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
TMEM200C-201ENST00000383490 WIZO95785 1651 aa44.33■■■■■ 4.69
TMEM200C-201ENST00000383490 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.17■■■■■ 4.66
TMEM200C-201ENST00000383490 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.14■■■■■ 4.66
TMEM200C-201ENST00000383490 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.13■■■■■ 4.65
TMEM200C-201ENST00000383490 SMARCA2P51531 1590 aa44.06■■■■■ 4.64
TMEM200C-201ENST00000383490 NCAPD3P42695 1498 aa43.91■■■■■ 4.62
TMEM200C-201ENST00000383490 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
TMEM200C-201ENST00000383490 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.85■■■■■ 4.61
TMEM200C-201ENST00000383490 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.61
TMEM200C-201ENST00000383490 HMGXB3Q12766 1538 aa43.73■■■■■ 4.59
TMEM200C-201ENST00000383490 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.42■■■■■ 4.54
TMEM200C-201ENST00000383490 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.1■■■■■ 4.49
TMEM200C-201ENST00000383490 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.75■■■■■ 4.43
TMEM200C-201ENST00000383490 CFTRP13569 1480 aa42.73■■■■■ 4.43
TMEM200C-201ENST00000383490 NESP48681 1621 aa42.65■■■■■ 4.42
TMEM200C-201ENST00000383490 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.48■■■■■ 4.39
TMEM200C-201ENST00000383490 PRDM2Q13029 1718 aa42.31■■■■■ 4.36
TMEM200C-201ENST00000383490 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.26■■■■■ 4.36
TMEM200C-201ENST00000383490 ABCC8Q09428 1581 aa42.26■■■■■ 4.36
TMEM200C-201ENST00000383490 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.22■■■■■ 4.35
TMEM200C-201ENST00000383490 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.07■■■■■ 4.33
TMEM200C-201ENST00000383490 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.05■■■■■ 4.32
TMEM200C-201ENST00000383490 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.03■■■■■ 4.32
TMEM200C-201ENST00000383490 TRIM41Q8WV44 630 aa42.03■■■■■ 4.32
TMEM200C-201ENST00000383490 SYNJ1O43426 1573 aa41.92■■■■■ 4.3
TMEM200C-201ENST00000383490 ERCC6Q03468 1493 aa41.91■■■■■ 4.3
TMEM200C-201ENST00000383490 CUX1P39880 1505 aa41.89■■■■■ 4.3
TMEM200C-201ENST00000383490 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
TMEM200C-201ENST00000383490 TOP2BQ02880 1626 aa41.77■■■■■ 4.28
TMEM200C-201ENST00000383490 TOPBP1Q92547 1522 aa41.71■■■■■ 4.27
TMEM200C-201ENST00000383490 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.71■■■■■ 4.27
TMEM200C-201ENST00000383490 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.71■■■■■ 4.27
TMEM200C-201ENST00000383490 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.7■■■■■ 4.27
TMEM200C-201ENST00000383490 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
TMEM200C-201ENST00000383490 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.55■■■■■ 4.24
TMEM200C-201ENST00000383490 WDR62O43379 1518 aa41.52■■■■■ 4.24
TMEM200C-201ENST00000383490 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
TMEM200C-201ENST00000383490 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.44■■■■■ 4.22
TMEM200C-201ENST00000383490 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.36■■■■■ 4.21
TMEM200C-201ENST00000383490 SOGA1O94964 1423 aa41.35■■■■■ 4.21
TMEM200C-201ENST00000383490 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
TMEM200C-201ENST00000383490 CUX2O14529 1486 aa41.27■■■■■ 4.2
TMEM200C-201ENST00000383490 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.26■■■■■ 4.19
TMEM200C-201ENST00000383490 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.14■■■■■ 4.18
TMEM200C-201ENST00000383490 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
TMEM200C-201ENST00000383490 IFT140Q96RY7 1462 aa41.08■■■■■ 4.17
TMEM200C-201ENST00000383490 KIF27Q86VH2 1401 aa41.06■■■■■ 4.16
TMEM200C-201ENST00000383490 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
TMEM200C-201ENST00000383490 WDR97A6NE52 1622 aa41.02■■■■■ 4.16
TMEM200C-201ENST00000383490 EEA1Q15075 1411 aa40.99■■■■■ 4.15
TMEM200C-201ENST00000383490 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
TMEM200C-201ENST00000383490 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.95■■■■■ 4.15
TMEM200C-201ENST00000383490 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.9■■■■■ 4.14
TMEM200C-201ENST00000383490 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.85■■■■■ 4.13
TMEM200C-201ENST00000383490 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.84■■■■■ 4.13
TMEM200C-201ENST00000383490 IGF1RP08069 1367 aa40.83■■■■■ 4.13
TMEM200C-201ENST00000383490 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.77■■■■■ 4.12
TMEM200C-201ENST00000383490 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
TMEM200C-201ENST00000383490 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.63■■■■■ 4.09
TMEM200C-201ENST00000383490 GRIN2BQ13224 1484 aa40.63■■■■■ 4.09
TMEM200C-201ENST00000383490 PRXQ9BXM0 1461 aa40.61■■■■■ 4.09
TMEM200C-201ENST00000383490 PBRM1Q86U86 1689 aa40.59■■■■■ 4.09
TMEM200C-201ENST00000383490 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.58■■■■■ 4.09
TMEM200C-201ENST00000383490 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.52■■■■■ 4.08
TMEM200C-201ENST00000383490 KIF21BO75037 1637 aa40.5■■■■■ 4.07
TMEM200C-201ENST00000383490 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.47■■■■■ 4.07
TMEM200C-201ENST00000383490 CUL7Q14999 1698 aa40.45■■■■■ 4.07
TMEM200C-201ENST00000383490 GOLGA3Q08378 1498 aa40.43■■■■■ 4.06
TMEM200C-201ENST00000383490 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.38■■■■■ 4.05
TMEM200C-201ENST00000383490 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.38■■■■■ 4.05
TMEM200C-201ENST00000383490 ADAMTS12P58397 1594 aa40.37■■■■■ 4.05
TMEM200C-201ENST00000383490 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
TMEM200C-201ENST00000383490 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
TMEM200C-201ENST00000383490 FBLN2P98095 1184 aa40.24■■■■■ 4.03
TMEM200C-201ENST00000383490 SYNJ2O15056 1496 aa40.23■■■■■ 4.03
TMEM200C-201ENST00000383490 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
TMEM200C-201ENST00000383490 CEP162Q5TB80 1403 aa40.22■■■■■ 4.03
TMEM200C-201ENST00000383490 GRIN2AQ12879 1464 aa40.14■■■■■ 4.02
TMEM200C-201ENST00000383490 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.11■■■■■ 4.01
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