Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PDCL3Q9H2J4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PDCL3Q9H2J4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PDCL3Q9H2J4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PDCL3Q9H2J4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PDCL3Q9H2J4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PDCL3Q9H2J4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PDCL3Q9H2J4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDCL3Q9H2J4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PDCL3Q9H2J4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PDCL3Q9H2J4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PDCL3Q9H2J4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDCL3Q9H2J4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
PDCL3Q9H2J4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PDCL3Q9H2J4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PDCL3Q9H2J4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PDCL3Q9H2J4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PDCL3Q9H2J4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDCL3Q9H2J4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PDCL3Q9H2J4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PDCL3Q9H2J4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDCL3Q9H2J4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PDCL3Q9H2J4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDCL3Q9H2J4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDCL3Q9H2J4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDCL3Q9H2J4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDCL3Q9H2J4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDCL3Q9H2J4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDCL3Q9H2J4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDCL3Q9H2J4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDCL3Q9H2J4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PDCL3Q9H2J4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PDCL3Q9H2J4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDCL3Q9H2J4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDCL3Q9H2J4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDCL3Q9H2J4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDCL3Q9H2J4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDCL3Q9H2J4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDCL3Q9H2J4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDCL3Q9H2J4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDCL3Q9H2J4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDCL3Q9H2J4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PDCL3Q9H2J4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PDCL3Q9H2J4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PDCL3Q9H2J4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDCL3Q9H2J4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PDCL3Q9H2J4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDCL3Q9H2J4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDCL3Q9H2J4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PDCL3Q9H2J4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PDCL3Q9H2J4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDCL3Q9H2J4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PDCL3Q9H2J4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDCL3Q9H2J4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDCL3Q9H2J4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDCL3Q9H2J4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDCL3Q9H2J4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PDCL3Q9H2J4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDCL3Q9H2J4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDCL3Q9H2J4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDCL3Q9H2J4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PDCL3Q9H2J4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PDCL3Q9H2J4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PDCL3Q9H2J4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PDCL3Q9H2J4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
PDCL3Q9H2J4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PDCL3Q9H2J4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PDCL3Q9H2J4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDCL3Q9H2J4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDCL3Q9H2J4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDCL3Q9H2J4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDCL3Q9H2J4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDCL3Q9H2J4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PDCL3Q9H2J4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDCL3Q9H2J4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDCL3Q9H2J4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDCL3Q9H2J4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PDCL3Q9H2J4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PDCL3Q9H2J4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDCL3Q9H2J4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PDCL3Q9H2J4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDCL3Q9H2J4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PDCL3Q9H2J4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PDCL3Q9H2J4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDCL3Q9H2J4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PDCL3Q9H2J4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDCL3Q9H2J4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDCL3Q9H2J4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDCL3Q9H2J4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PDCL3Q9H2J4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDCL3Q9H2J4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDCL3Q9H2J4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDCL3Q9H2J4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PDCL3Q9H2J4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDCL3Q9H2J4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PDCL3Q9H2J4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDCL3Q9H2J4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDCL3Q9H2J4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PDCL3Q9H2J4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PDCL3Q9H2J4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms