Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1N7

SLC35B3, Adenosine 3'-phospho 5'-phosphosulfate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B3Q9H1N7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC35B3Q9H1N7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC35B3Q9H1N7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC35B3Q9H1N7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC35B3Q9H1N7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC35B3Q9H1N7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC35B3Q9H1N7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC35B3Q9H1N7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC35B3Q9H1N7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC35B3Q9H1N7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC35B3Q9H1N7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC35B3Q9H1N7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC35B3Q9H1N7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC35B3Q9H1N7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC35B3Q9H1N7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35B3Q9H1N7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC35B3Q9H1N7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC35B3Q9H1N7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35B3Q9H1N7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35B3Q9H1N7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC35B3Q9H1N7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC35B3Q9H1N7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC35B3Q9H1N7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35B3Q9H1N7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35B3Q9H1N7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35B3Q9H1N7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC35B3Q9H1N7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35B3Q9H1N7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35B3Q9H1N7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35B3Q9H1N7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35B3Q9H1N7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35B3Q9H1N7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35B3Q9H1N7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC35B3Q9H1N7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC35B3Q9H1N7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC35B3Q9H1N7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC35B3Q9H1N7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35B3Q9H1N7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35B3Q9H1N7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35B3Q9H1N7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35B3Q9H1N7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35B3Q9H1N7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35B3Q9H1N7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35B3Q9H1N7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35B3Q9H1N7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC35B3Q9H1N7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35B3Q9H1N7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC35B3Q9H1N7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC35B3Q9H1N7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC35B3Q9H1N7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC35B3Q9H1N7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC35B3Q9H1N7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC35B3Q9H1N7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC35B3Q9H1N7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC35B3Q9H1N7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC35B3Q9H1N7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC35B3Q9H1N7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC35B3Q9H1N7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC35B3Q9H1N7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC35B3Q9H1N7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC35B3Q9H1N7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35B3Q9H1N7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35B3Q9H1N7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35B3Q9H1N7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC35B3Q9H1N7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35B3Q9H1N7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35B3Q9H1N7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC35B3Q9H1N7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC35B3Q9H1N7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC35B3Q9H1N7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC35B3Q9H1N7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC35B3Q9H1N7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35B3Q9H1N7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35B3Q9H1N7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35B3Q9H1N7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC35B3Q9H1N7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC35B3Q9H1N7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35B3Q9H1N7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35B3Q9H1N7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC35B3Q9H1N7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC35B3Q9H1N7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35B3Q9H1N7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35B3Q9H1N7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC35B3Q9H1N7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC35B3Q9H1N7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC35B3Q9H1N7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC35B3Q9H1N7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC35B3Q9H1N7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35B3Q9H1N7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35B3Q9H1N7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35B3Q9H1N7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35B3Q9H1N7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35B3Q9H1N7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35B3Q9H1N7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35B3Q9H1N7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35B3Q9H1N7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35B3Q9H1N7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35B3Q9H1N7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35B3Q9H1N7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC35B3Q9H1N7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms