Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ELF3P78545 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ELF3P78545 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ELF3P78545 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ELF3P78545 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ELF3P78545 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ELF3P78545 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ELF3P78545 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ELF3P78545 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ELF3P78545 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ELF3P78545 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ELF3P78545 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ELF3P78545 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ELF3P78545 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ELF3P78545 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ELF3P78545 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ELF3P78545 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ELF3P78545 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ELF3P78545 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ELF3P78545 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ELF3P78545 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ELF3P78545 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ELF3P78545 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ELF3P78545 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ELF3P78545 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ELF3P78545 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ELF3P78545 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ELF3P78545 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ELF3P78545 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ELF3P78545 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ELF3P78545 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ELF3P78545 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ELF3P78545 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ELF3P78545 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ELF3P78545 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ELF3P78545 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ELF3P78545 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ELF3P78545 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ELF3P78545 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ELF3P78545 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ELF3P78545 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ELF3P78545 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ELF3P78545 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ELF3P78545 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ELF3P78545 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ELF3P78545 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ELF3P78545 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ELF3P78545 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ELF3P78545 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ELF3P78545 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ELF3P78545 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ELF3P78545 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ELF3P78545 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ELF3P78545 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ELF3P78545 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ELF3P78545 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ELF3P78545 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ELF3P78545 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ELF3P78545 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ELF3P78545 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ELF3P78545 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ELF3P78545 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ELF3P78545 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ELF3P78545 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ELF3P78545 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ELF3P78545 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ELF3P78545 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ELF3P78545 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ELF3P78545 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ELF3P78545 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ELF3P78545 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ELF3P78545 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ELF3P78545 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ELF3P78545 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELF3P78545 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ELF3P78545 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ELF3P78545 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ELF3P78545 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ELF3P78545 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ELF3P78545 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ELF3P78545 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ELF3P78545 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ELF3P78545 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ELF3P78545 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ELF3P78545 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ELF3P78545 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ELF3P78545 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ELF3P78545 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ELF3P78545 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ELF3P78545 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ELF3P78545 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ELF3P78545 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ELF3P78545 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ELF3P78545 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ELF3P78545 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ELF3P78545 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ELF3P78545 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ELF3P78545 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ELF3P78545 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ELF3P78545 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms