Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SLC4A3P48751 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SLC4A3P48751 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SLC4A3P48751 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SLC4A3P48751 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SLC4A3P48751 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
SLC4A3P48751 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SLC4A3P48751 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SLC4A3P48751 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SLC4A3P48751 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SLC4A3P48751 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SLC4A3P48751 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SLC4A3P48751 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SLC4A3P48751 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SLC4A3P48751 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SLC4A3P48751 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SLC4A3P48751 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SLC4A3P48751 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SLC4A3P48751 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SLC4A3P48751 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SLC4A3P48751 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SLC4A3P48751 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
SLC4A3P48751 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SLC4A3P48751 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SLC4A3P48751 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SLC4A3P48751 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SLC4A3P48751 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SLC4A3P48751 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SLC4A3P48751 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SLC4A3P48751 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SLC4A3P48751 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SLC4A3P48751 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SLC4A3P48751 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SLC4A3P48751 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SLC4A3P48751 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SLC4A3P48751 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SLC4A3P48751 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SLC4A3P48751 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SLC4A3P48751 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SLC4A3P48751 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SLC4A3P48751 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SLC4A3P48751 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SLC4A3P48751 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SLC4A3P48751 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SLC4A3P48751 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SLC4A3P48751 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SLC4A3P48751 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SLC4A3P48751 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SLC4A3P48751 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SLC4A3P48751 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SLC4A3P48751 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SLC4A3P48751 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SLC4A3P48751 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SLC4A3P48751 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SLC4A3P48751 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SLC4A3P48751 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SLC4A3P48751 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SLC4A3P48751 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SLC4A3P48751 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SLC4A3P48751 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SLC4A3P48751 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SLC4A3P48751 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SLC4A3P48751 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SLC4A3P48751 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SLC4A3P48751 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SLC4A3P48751 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SLC4A3P48751 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SLC4A3P48751 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SLC4A3P48751 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SLC4A3P48751 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SLC4A3P48751 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SLC4A3P48751 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SLC4A3P48751 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SLC4A3P48751 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SLC4A3P48751 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SLC4A3P48751 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SLC4A3P48751 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SLC4A3P48751 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SLC4A3P48751 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SLC4A3P48751 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SLC4A3P48751 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SLC4A3P48751 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SLC4A3P48751 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SLC4A3P48751 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SLC4A3P48751 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SLC4A3P48751 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SLC4A3P48751 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SLC4A3P48751 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SLC4A3P48751 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SLC4A3P48751 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SLC4A3P48751 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
SLC4A3P48751 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SLC4A3P48751 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SLC4A3P48751 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SLC4A3P48751 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SLC4A3P48751 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SLC4A3P48751 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SLC4A3P48751 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SLC4A3P48751 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SLC4A3P48751 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms