Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
S100A1P23297 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
S100A1P23297 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
S100A1P23297 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
S100A1P23297 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
S100A1P23297 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
S100A1P23297 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
S100A1P23297 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
S100A1P23297 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
S100A1P23297 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
S100A1P23297 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
S100A1P23297 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
S100A1P23297 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
S100A1P23297 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
S100A1P23297 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
S100A1P23297 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
S100A1P23297 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
S100A1P23297 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
S100A1P23297 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
S100A1P23297 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
S100A1P23297 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
S100A1P23297 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
S100A1P23297 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
S100A1P23297 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
S100A1P23297 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
S100A1P23297 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
S100A1P23297 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
S100A1P23297 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
S100A1P23297 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
S100A1P23297 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
S100A1P23297 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
S100A1P23297 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
S100A1P23297 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
S100A1P23297 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
S100A1P23297 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
S100A1P23297 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
S100A1P23297 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
S100A1P23297 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
S100A1P23297 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
S100A1P23297 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
S100A1P23297 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
S100A1P23297 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
S100A1P23297 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
S100A1P23297 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
S100A1P23297 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
S100A1P23297 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
S100A1P23297 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
S100A1P23297 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
S100A1P23297 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
S100A1P23297 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
S100A1P23297 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
S100A1P23297 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
S100A1P23297 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
S100A1P23297 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
S100A1P23297 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
S100A1P23297 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
S100A1P23297 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
S100A1P23297 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
S100A1P23297 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
S100A1P23297 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
S100A1P23297 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
S100A1P23297 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
S100A1P23297 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
S100A1P23297 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
S100A1P23297 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
S100A1P23297 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
S100A1P23297 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
S100A1P23297 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
S100A1P23297 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
S100A1P23297 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
S100A1P23297 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
S100A1P23297 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
S100A1P23297 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
S100A1P23297 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
S100A1P23297 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
S100A1P23297 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
S100A1P23297 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
S100A1P23297 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
S100A1P23297 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
S100A1P23297 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
S100A1P23297 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
S100A1P23297 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
S100A1P23297 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
S100A1P23297 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
S100A1P23297 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
S100A1P23297 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
S100A1P23297 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
S100A1P23297 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
S100A1P23297 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
S100A1P23297 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
S100A1P23297 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
S100A1P23297 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
S100A1P23297 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
S100A1P23297 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
S100A1P23297 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
S100A1P23297 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
S100A1P23297 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
S100A1P23297 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
S100A1P23297 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
S100A1P23297 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms