Protein–RNA interactions for Protein: P05109

S100A8, Protein S100-A8, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A8P05109 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
S100A8P05109 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
S100A8P05109 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
S100A8P05109 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
S100A8P05109 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
S100A8P05109 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
S100A8P05109 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
S100A8P05109 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
S100A8P05109 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
S100A8P05109 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
S100A8P05109 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
S100A8P05109 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
S100A8P05109 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
S100A8P05109 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
S100A8P05109 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
S100A8P05109 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
S100A8P05109 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
S100A8P05109 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
S100A8P05109 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
S100A8P05109 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
S100A8P05109 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
S100A8P05109 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
S100A8P05109 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
S100A8P05109 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
S100A8P05109 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
S100A8P05109 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
S100A8P05109 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
S100A8P05109 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
S100A8P05109 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
S100A8P05109 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
S100A8P05109 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
S100A8P05109 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
S100A8P05109 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
S100A8P05109 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
S100A8P05109 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
S100A8P05109 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
S100A8P05109 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
S100A8P05109 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
S100A8P05109 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
S100A8P05109 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
S100A8P05109 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
S100A8P05109 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
S100A8P05109 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
S100A8P05109 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
S100A8P05109 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
S100A8P05109 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
S100A8P05109 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
S100A8P05109 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
S100A8P05109 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
S100A8P05109 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
S100A8P05109 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
S100A8P05109 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
S100A8P05109 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
S100A8P05109 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
S100A8P05109 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
S100A8P05109 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S100A8P05109 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S100A8P05109 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
S100A8P05109 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
S100A8P05109 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
S100A8P05109 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
S100A8P05109 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S100A8P05109 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
S100A8P05109 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
S100A8P05109 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S100A8P05109 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S100A8P05109 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
S100A8P05109 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S100A8P05109 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S100A8P05109 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S100A8P05109 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S100A8P05109 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
S100A8P05109 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S100A8P05109 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
S100A8P05109 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S100A8P05109 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S100A8P05109 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
S100A8P05109 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S100A8P05109 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
S100A8P05109 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
S100A8P05109 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
S100A8P05109 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
S100A8P05109 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
S100A8P05109 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
S100A8P05109 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
S100A8P05109 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
S100A8P05109 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
S100A8P05109 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
S100A8P05109 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
S100A8P05109 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
S100A8P05109 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
S100A8P05109 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
S100A8P05109 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
S100A8P05109 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
S100A8P05109 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
S100A8P05109 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
S100A8P05109 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
S100A8P05109 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
S100A8P05109 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
S100A8P05109 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms