Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLPXO76031 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CLPXO76031 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLPXO76031 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLPXO76031 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLPXO76031 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLPXO76031 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLPXO76031 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLPXO76031 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLPXO76031 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLPXO76031 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLPXO76031 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLPXO76031 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLPXO76031 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLPXO76031 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLPXO76031 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLPXO76031 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLPXO76031 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLPXO76031 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLPXO76031 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLPXO76031 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLPXO76031 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLPXO76031 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLPXO76031 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLPXO76031 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLPXO76031 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLPXO76031 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLPXO76031 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLPXO76031 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLPXO76031 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLPXO76031 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLPXO76031 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLPXO76031 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLPXO76031 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLPXO76031 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLPXO76031 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLPXO76031 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLPXO76031 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLPXO76031 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLPXO76031 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLPXO76031 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLPXO76031 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLPXO76031 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLPXO76031 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLPXO76031 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLPXO76031 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLPXO76031 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLPXO76031 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLPXO76031 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLPXO76031 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLPXO76031 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLPXO76031 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLPXO76031 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLPXO76031 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLPXO76031 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLPXO76031 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLPXO76031 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLPXO76031 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLPXO76031 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLPXO76031 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLPXO76031 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLPXO76031 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLPXO76031 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLPXO76031 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLPXO76031 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLPXO76031 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLPXO76031 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLPXO76031 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLPXO76031 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLPXO76031 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLPXO76031 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLPXO76031 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLPXO76031 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLPXO76031 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLPXO76031 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLPXO76031 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLPXO76031 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLPXO76031 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLPXO76031 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLPXO76031 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLPXO76031 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLPXO76031 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLPXO76031 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLPXO76031 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLPXO76031 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLPXO76031 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLPXO76031 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLPXO76031 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLPXO76031 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLPXO76031 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLPXO76031 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLPXO76031 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLPXO76031 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLPXO76031 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLPXO76031 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLPXO76031 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLPXO76031 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLPXO76031 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLPXO76031 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLPXO76031 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms