Protein–RNA interactions for Protein: O75841

UPK1B, Uroplakin-1b, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1BO75841 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
UPK1BO75841 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPK1BO75841 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UPK1BO75841 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UPK1BO75841 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UPK1BO75841 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UPK1BO75841 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UPK1BO75841 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UPK1BO75841 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UPK1BO75841 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UPK1BO75841 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UPK1BO75841 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UPK1BO75841 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UPK1BO75841 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPK1BO75841 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPK1BO75841 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UPK1BO75841 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPK1BO75841 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPK1BO75841 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPK1BO75841 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPK1BO75841 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPK1BO75841 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
UPK1BO75841 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UPK1BO75841 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPK1BO75841 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPK1BO75841 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UPK1BO75841 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPK1BO75841 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPK1BO75841 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPK1BO75841 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UPK1BO75841 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPK1BO75841 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPK1BO75841 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPK1BO75841 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPK1BO75841 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
UPK1BO75841 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPK1BO75841 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPK1BO75841 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPK1BO75841 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPK1BO75841 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPK1BO75841 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPK1BO75841 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPK1BO75841 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPK1BO75841 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPK1BO75841 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPK1BO75841 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPK1BO75841 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UPK1BO75841 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPK1BO75841 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UPK1BO75841 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UPK1BO75841 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UPK1BO75841 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UPK1BO75841 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UPK1BO75841 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPK1BO75841 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPK1BO75841 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UPK1BO75841 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPK1BO75841 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPK1BO75841 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPK1BO75841 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UPK1BO75841 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UPK1BO75841 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UPK1BO75841 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UPK1BO75841 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UPK1BO75841 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UPK1BO75841 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UPK1BO75841 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UPK1BO75841 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UPK1BO75841 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UPK1BO75841 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPK1BO75841 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPK1BO75841 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPK1BO75841 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPK1BO75841 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPK1BO75841 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPK1BO75841 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPK1BO75841 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPK1BO75841 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPK1BO75841 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPK1BO75841 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPK1BO75841 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPK1BO75841 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPK1BO75841 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPK1BO75841 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPK1BO75841 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPK1BO75841 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPK1BO75841 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPK1BO75841 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPK1BO75841 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UPK1BO75841 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPK1BO75841 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPK1BO75841 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPK1BO75841 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPK1BO75841 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPK1BO75841 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPK1BO75841 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPK1BO75841 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPK1BO75841 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPK1BO75841 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UPK1BO75841 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms