Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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