Protein–RNA interactions for Protein: Q96HA1

POM121, Nuclear envelope pore membrane protein POM 121, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POM121Q96HA1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POM121Q96HA1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121Q96HA1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POM121Q96HA1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POM121Q96HA1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms