Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO39Q8N4B4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO39Q8N4B4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO39Q8N4B4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO39Q8N4B4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO39Q8N4B4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO39Q8N4B4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO39Q8N4B4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO39Q8N4B4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO39Q8N4B4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO39Q8N4B4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO39Q8N4B4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO39Q8N4B4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO39Q8N4B4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO39Q8N4B4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO39Q8N4B4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO39Q8N4B4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FBXO39Q8N4B4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO39Q8N4B4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms