Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC55Q6ZSA7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC55Q6ZSA7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC55Q6ZSA7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC55Q6ZSA7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC55Q6ZSA7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC55Q6ZSA7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC55Q6ZSA7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC55Q6ZSA7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC55Q6ZSA7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC55Q6ZSA7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC55Q6ZSA7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC55Q6ZSA7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC55Q6ZSA7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms