Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TREML4Q6UXN2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREML4Q6UXN2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TREML4Q6UXN2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREML4Q6UXN2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms