Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPSNQ13702 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPSNQ13702 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAPSNQ13702 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPSNQ13702 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPSNQ13702 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPSNQ13702 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPSNQ13702 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPSNQ13702 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPSNQ13702 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPSNQ13702 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPSNQ13702 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms