Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERVPABLB-1P60509 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVPABLB-1P60509 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVPABLB-1P60509 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVPABLB-1P60509 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVPABLB-1P60509 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVPABLB-1P60509 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVPABLB-1P60509 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVPABLB-1P60509 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVPABLB-1P60509 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVPABLB-1P60509 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVPABLB-1P60509 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVPABLB-1P60509 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVPABLB-1P60509 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVPABLB-1P60509 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVPABLB-1P60509 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVPABLB-1P60509 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVPABLB-1P60509 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ERVPABLB-1P60509 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms