Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
N4BP1O75113 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
N4BP1O75113 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
N4BP1O75113 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
N4BP1O75113 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
N4BP1O75113 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
N4BP1O75113 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
N4BP1O75113 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
N4BP1O75113 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
N4BP1O75113 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
N4BP1O75113 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
N4BP1O75113 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP1O75113 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
N4BP1O75113 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
N4BP1O75113 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP1O75113 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP1O75113 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP1O75113 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP1O75113 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP1O75113 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
N4BP1O75113 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP1O75113 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP1O75113 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP1O75113 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
N4BP1O75113 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
N4BP1O75113 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
N4BP1O75113 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
N4BP1O75113 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
N4BP1O75113 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
N4BP1O75113 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP1O75113 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP1O75113 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP1O75113 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP1O75113 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
N4BP1O75113 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
N4BP1O75113 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms