Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEMP2A6NFY4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEMP2A6NFY4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEMP2A6NFY4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEMP2A6NFY4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEMP2A6NFY4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEMP2A6NFY4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms