RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567180.2

SCX-201, Transcript of scleraxis bHLH transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCX, Length 999 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCX-201ENST00000567180 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.42■■■■■ 7.74
SCX-201ENST00000567180 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.37■■■■■ 6.62
SCX-201ENST00000567180 ABCC9O60706 1549 aa54.68■■■■■ 6.34
SCX-201ENST00000567180 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.9■■■■■ 6.06
SCX-201ENST00000567180 NACADO15069 1562 aa52.88■■■■■ 6.06
SCX-201ENST00000567180 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.88■■■■■ 6.06
SCX-201ENST00000567180 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.86■■■■■ 6.05
SCX-201ENST00000567180 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.66■■■■■ 6.02
SCX-201ENST00000567180 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.55■■■■■ 6
SCX-201ENST00000567180 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.64■■■■■ 5.86
SCX-201ENST00000567180 SCRIBQ14160 1630 aa51.37■■■■■ 5.81
SCX-201ENST00000567180 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.1■■■■■ 5.77
SCX-201ENST00000567180 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.08■■■■■ 5.77
SCX-201ENST00000567180 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.79■■■■■ 5.72
SCX-201ENST00000567180 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.81■■■■■ 5.56
SCX-201ENST00000567180 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.68■■■■■ 5.54
SCX-201ENST00000567180 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.52■■■■■ 5.52
SCX-201ENST00000567180 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.27■■■■■ 5.48
SCX-201ENST00000567180 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.22■■■■■ 5.47
SCX-201ENST00000567180 SMARCA4P51532 1647 aa49.18■■■■■ 5.46
SCX-201ENST00000567180 SMARCA2P51531 1590 aa48.85■■■■■ 5.41
SCX-201ENST00000567180 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.83■■■■■ 5.41
SCX-201ENST00000567180 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.77■■■■■ 5.4
SCX-201ENST00000567180 NCAPD3P42695 1498 aa48.7■■■■■ 5.39
SCX-201ENST00000567180 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.68■■■■■ 5.38
SCX-201ENST00000567180 HMGXB3Q12766 1538 aa48.57■■■■■ 5.37
SCX-201ENST00000567180 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.47■■■■■ 5.35
SCX-201ENST00000567180 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.39■■■■■ 5.34
SCX-201ENST00000567180 WIZO95785 1651 aa48.37■■■■■ 5.33
SCX-201ENST00000567180 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.92■■■■■ 5.26
SCX-201ENST00000567180 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.46■■■■■ 5.19
SCX-201ENST00000567180 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
SCX-201ENST00000567180 NESP48681 1621 aa47.36■■■■■ 5.17
SCX-201ENST00000567180 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.31■■■■■ 5.16
SCX-201ENST00000567180 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.27■■■■■ 5.16
SCX-201ENST00000567180 ERCC6Q03468 1493 aa47.22■■■■■ 5.15
SCX-201ENST00000567180 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.13■■■■■ 5.13
SCX-201ENST00000567180 CFTRP13569 1480 aa47.09■■■■■ 5.13
SCX-201ENST00000567180 PRDM2Q13029 1718 aa46.95■■■■■ 5.11
SCX-201ENST00000567180 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.94■■■■■ 5.1
SCX-201ENST00000567180 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.79■■■■■ 5.08
SCX-201ENST00000567180 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.75■■■■■ 5.07
SCX-201ENST00000567180 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.66■■■■■ 5.06
SCX-201ENST00000567180 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.59■■■■■ 5.05
SCX-201ENST00000567180 CUX2O14529 1486 aa46.58■■■■■ 5.05
SCX-201ENST00000567180 WDR62O43379 1518 aa46.41■■■■■ 5.02
SCX-201ENST00000567180 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.23■■■■■ 4.99
SCX-201ENST00000567180 ABCC8Q09428 1581 aa46.21■■■■■ 4.99
SCX-201ENST00000567180 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.1■■■■■ 4.97
SCX-201ENST00000567180 TOPBP1Q92547 1522 aa46.07■■■■■ 4.97
SCX-201ENST00000567180 CUX1P39880 1505 aa45.81■■■■■ 4.92
SCX-201ENST00000567180 IFT140Q96RY7 1462 aa45.74■■■■■ 4.91
SCX-201ENST00000567180 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.7■■■■■ 4.91
SCX-201ENST00000567180 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.68■■■■■ 4.9
SCX-201ENST00000567180 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.64■■■■■ 4.9
SCX-201ENST00000567180 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.59■■■■■ 4.89
SCX-201ENST00000567180 TOP2BQ02880 1626 aa45.58■■■■■ 4.89
SCX-201ENST00000567180 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.53■■■■■ 4.88
SCX-201ENST00000567180 SOGA1O94964 1423 aa45.52■■■■■ 4.88
SCX-201ENST00000567180 SYNJ1O43426 1573 aa45.52■■■■■ 4.88
SCX-201ENST00000567180 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.43■■■■■ 4.86
SCX-201ENST00000567180 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.38■■■■■ 4.86
SCX-201ENST00000567180 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.34■■■■■ 4.85
SCX-201ENST00000567180 WDR97A6NE52 1622 aa45.34■■■■■ 4.85
SCX-201ENST00000567180 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.23■■■■■ 4.83
SCX-201ENST00000567180 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.19■■■■■ 4.82
SCX-201ENST00000567180 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
SCX-201ENST00000567180 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.03■■■■■ 4.8
SCX-201ENST00000567180 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.03■■■■■ 4.8
SCX-201ENST00000567180 GRIN2BQ13224 1484 aa44.99■■■■■ 4.79
SCX-201ENST00000567180 PBRM1Q86U86 1689 aa44.98■■■■■ 4.79
SCX-201ENST00000567180 TRIM41Q8WV44 630 aa44.87■■■■■ 4.77
SCX-201ENST00000567180 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
SCX-201ENST00000567180 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.85■■■■■ 4.77
SCX-201ENST00000567180 KIF27Q86VH2 1401 aa44.76■■■■■ 4.76
SCX-201ENST00000567180 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.74■■■■■ 4.75
SCX-201ENST00000567180 CHD1O14646 1710 aa44.73■■■■■ 4.75
SCX-201ENST00000567180 OSCARQ8IYS5 282 aa44.68■■■■■ 4.74
SCX-201ENST00000567180 FBLN2P98095 1184 aa44.67■■■■■ 4.74
SCX-201ENST00000567180 SYNJ2O15056 1496 aa44.66■■■■■ 4.74
SCX-201ENST00000567180 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.63■■■■■ 4.74
SCX-201ENST00000567180 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
SCX-201ENST00000567180 ADAMTS12P58397 1594 aa44.59■■■■■ 4.73
SCX-201ENST00000567180 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.53■■■■■ 4.72
SCX-201ENST00000567180 CUL7Q14999 1698 aa44.47■■■■■ 4.71
SCX-201ENST00000567180 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.42■■■■■ 4.7
SCX-201ENST00000567180 IGF1RP08069 1367 aa44.41■■■■■ 4.7
SCX-201ENST00000567180 GRIN2AQ12879 1464 aa44.39■■■■■ 4.7
SCX-201ENST00000567180 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.27■■■■■ 4.68
SCX-201ENST00000567180 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.22■■■■■ 4.67
SCX-201ENST00000567180 EEA1Q15075 1411 aa44.18■■■■■ 4.66
SCX-201ENST00000567180 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.18■■■■■ 4.66
SCX-201ENST00000567180 NUP160Q12769 1436 aa44.15■■■■■ 4.66
SCX-201ENST00000567180 CEP170Q5SW79 1584 aa44.12■■■■■ 4.65
SCX-201ENST00000567180 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.04■■■■■ 4.64
SCX-201ENST00000567180 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.96■■■■■ 4.63
SCX-201ENST00000567180 ARHGEF11O15085 1522 aa43.94■■■■■ 4.62
SCX-201ENST00000567180 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.91■■■■■ 4.62
SCX-201ENST00000567180 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.91■■■■■ 4.62
SCX-201ENST00000567180 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.91■■■■■ 4.62
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