Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E8

PCDHB15, Protocadherin beta-15, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB15Q9Y5E8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCDHB15Q9Y5E8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCDHB15Q9Y5E8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCDHB15Q9Y5E8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCDHB15Q9Y5E8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCDHB15Q9Y5E8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PCDHB15Q9Y5E8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PCDHB15Q9Y5E8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCDHB15Q9Y5E8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCDHB15Q9Y5E8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCDHB15Q9Y5E8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCDHB15Q9Y5E8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCDHB15Q9Y5E8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCDHB15Q9Y5E8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCDHB15Q9Y5E8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCDHB15Q9Y5E8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCDHB15Q9Y5E8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCDHB15Q9Y5E8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PCDHB15Q9Y5E8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PCDHB15Q9Y5E8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PCDHB15Q9Y5E8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PCDHB15Q9Y5E8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PCDHB15Q9Y5E8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PCDHB15Q9Y5E8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PCDHB15Q9Y5E8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PCDHB15Q9Y5E8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PCDHB15Q9Y5E8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PCDHB15Q9Y5E8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PCDHB15Q9Y5E8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PCDHB15Q9Y5E8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PCDHB15Q9Y5E8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PCDHB15Q9Y5E8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PCDHB15Q9Y5E8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PCDHB15Q9Y5E8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PCDHB15Q9Y5E8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PCDHB15Q9Y5E8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PCDHB15Q9Y5E8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PCDHB15Q9Y5E8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PCDHB15Q9Y5E8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PCDHB15Q9Y5E8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PCDHB15Q9Y5E8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PCDHB15Q9Y5E8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PCDHB15Q9Y5E8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PCDHB15Q9Y5E8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PCDHB15Q9Y5E8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PCDHB15Q9Y5E8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PCDHB15Q9Y5E8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PCDHB15Q9Y5E8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCDHB15Q9Y5E8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCDHB15Q9Y5E8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCDHB15Q9Y5E8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PCDHB15Q9Y5E8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PCDHB15Q9Y5E8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PCDHB15Q9Y5E8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PCDHB15Q9Y5E8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PCDHB15Q9Y5E8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PCDHB15Q9Y5E8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCDHB15Q9Y5E8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PCDHB15Q9Y5E8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PCDHB15Q9Y5E8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PCDHB15Q9Y5E8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PCDHB15Q9Y5E8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCDHB15Q9Y5E8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PCDHB15Q9Y5E8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PCDHB15Q9Y5E8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PCDHB15Q9Y5E8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PCDHB15Q9Y5E8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PCDHB15Q9Y5E8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PCDHB15Q9Y5E8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PCDHB15Q9Y5E8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PCDHB15Q9Y5E8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PCDHB15Q9Y5E8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PCDHB15Q9Y5E8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PCDHB15Q9Y5E8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PCDHB15Q9Y5E8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PCDHB15Q9Y5E8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PCDHB15Q9Y5E8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PCDHB15Q9Y5E8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PCDHB15Q9Y5E8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PCDHB15Q9Y5E8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PCDHB15Q9Y5E8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PCDHB15Q9Y5E8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PCDHB15Q9Y5E8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PCDHB15Q9Y5E8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PCDHB15Q9Y5E8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PCDHB15Q9Y5E8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PCDHB15Q9Y5E8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PCDHB15Q9Y5E8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PCDHB15Q9Y5E8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PCDHB15Q9Y5E8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PCDHB15Q9Y5E8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PCDHB15Q9Y5E8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PCDHB15Q9Y5E8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PCDHB15Q9Y5E8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PCDHB15Q9Y5E8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PCDHB15Q9Y5E8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCDHB15Q9Y5E8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCDHB15Q9Y5E8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCDHB15Q9Y5E8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PCDHB15Q9Y5E8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1232.1 ms