Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SAE1Q9UBE0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAE1Q9UBE0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAE1Q9UBE0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SAE1Q9UBE0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAE1Q9UBE0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAE1Q9UBE0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAE1Q9UBE0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAE1Q9UBE0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAE1Q9UBE0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAE1Q9UBE0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAE1Q9UBE0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SAE1Q9UBE0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SAE1Q9UBE0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SAE1Q9UBE0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SAE1Q9UBE0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SAE1Q9UBE0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SAE1Q9UBE0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SAE1Q9UBE0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SAE1Q9UBE0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SAE1Q9UBE0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SAE1Q9UBE0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAE1Q9UBE0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAE1Q9UBE0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SAE1Q9UBE0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SAE1Q9UBE0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SAE1Q9UBE0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAE1Q9UBE0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAE1Q9UBE0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAE1Q9UBE0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAE1Q9UBE0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAE1Q9UBE0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAE1Q9UBE0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAE1Q9UBE0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAE1Q9UBE0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAE1Q9UBE0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAE1Q9UBE0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAE1Q9UBE0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SAE1Q9UBE0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SAE1Q9UBE0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAE1Q9UBE0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAE1Q9UBE0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SAE1Q9UBE0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAE1Q9UBE0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAE1Q9UBE0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAE1Q9UBE0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAE1Q9UBE0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAE1Q9UBE0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAE1Q9UBE0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAE1Q9UBE0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAE1Q9UBE0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAE1Q9UBE0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAE1Q9UBE0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAE1Q9UBE0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAE1Q9UBE0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAE1Q9UBE0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAE1Q9UBE0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAE1Q9UBE0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAE1Q9UBE0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAE1Q9UBE0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAE1Q9UBE0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAE1Q9UBE0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAE1Q9UBE0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAE1Q9UBE0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAE1Q9UBE0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAE1Q9UBE0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAE1Q9UBE0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms