Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GIN1Q9NXP7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GIN1Q9NXP7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GIN1Q9NXP7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GIN1Q9NXP7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GIN1Q9NXP7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GIN1Q9NXP7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GIN1Q9NXP7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GIN1Q9NXP7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GIN1Q9NXP7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GIN1Q9NXP7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GIN1Q9NXP7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GIN1Q9NXP7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GIN1Q9NXP7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GIN1Q9NXP7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GIN1Q9NXP7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIN1Q9NXP7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GIN1Q9NXP7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GIN1Q9NXP7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms