Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX05

FAM120C, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120CQ9NX05 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FAM120CQ9NX05 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FAM120CQ9NX05 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM120CQ9NX05 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM120CQ9NX05 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM120CQ9NX05 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM120CQ9NX05 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM120CQ9NX05 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM120CQ9NX05 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM120CQ9NX05 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM120CQ9NX05 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM120CQ9NX05 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM120CQ9NX05 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM120CQ9NX05 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM120CQ9NX05 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM120CQ9NX05 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM120CQ9NX05 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM120CQ9NX05 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM120CQ9NX05 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM120CQ9NX05 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM120CQ9NX05 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM120CQ9NX05 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM120CQ9NX05 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM120CQ9NX05 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM120CQ9NX05 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM120CQ9NX05 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM120CQ9NX05 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM120CQ9NX05 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM120CQ9NX05 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM120CQ9NX05 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM120CQ9NX05 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM120CQ9NX05 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM120CQ9NX05 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM120CQ9NX05 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM120CQ9NX05 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM120CQ9NX05 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM120CQ9NX05 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM120CQ9NX05 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM120CQ9NX05 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM120CQ9NX05 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM120CQ9NX05 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM120CQ9NX05 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM120CQ9NX05 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM120CQ9NX05 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM120CQ9NX05 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM120CQ9NX05 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM120CQ9NX05 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM120CQ9NX05 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM120CQ9NX05 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM120CQ9NX05 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM120CQ9NX05 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM120CQ9NX05 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM120CQ9NX05 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM120CQ9NX05 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM120CQ9NX05 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM120CQ9NX05 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM120CQ9NX05 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM120CQ9NX05 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM120CQ9NX05 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM120CQ9NX05 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM120CQ9NX05 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM120CQ9NX05 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM120CQ9NX05 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM120CQ9NX05 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM120CQ9NX05 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms