Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD90

NEUROD4, Neurogenic differentiation factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD4Q9HD90 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD4Q9HD90 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD4Q9HD90 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD4Q9HD90 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD4Q9HD90 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEUROD4Q9HD90 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD4Q9HD90 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD4Q9HD90 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD4Q9HD90 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD4Q9HD90 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD4Q9HD90 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD4Q9HD90 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD4Q9HD90 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD4Q9HD90 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD4Q9HD90 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD4Q9HD90 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD4Q9HD90 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD4Q9HD90 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD4Q9HD90 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms