Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XAB2Q9HCS7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XAB2Q9HCS7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XAB2Q9HCS7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XAB2Q9HCS7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XAB2Q9HCS7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
XAB2Q9HCS7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XAB2Q9HCS7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XAB2Q9HCS7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XAB2Q9HCS7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XAB2Q9HCS7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
XAB2Q9HCS7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XAB2Q9HCS7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XAB2Q9HCS7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
XAB2Q9HCS7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XAB2Q9HCS7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XAB2Q9HCS7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XAB2Q9HCS7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XAB2Q9HCS7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XAB2Q9HCS7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XAB2Q9HCS7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XAB2Q9HCS7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XAB2Q9HCS7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XAB2Q9HCS7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XAB2Q9HCS7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XAB2Q9HCS7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XAB2Q9HCS7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
XAB2Q9HCS7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
XAB2Q9HCS7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XAB2Q9HCS7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XAB2Q9HCS7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XAB2Q9HCS7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
XAB2Q9HCS7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XAB2Q9HCS7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XAB2Q9HCS7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XAB2Q9HCS7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
XAB2Q9HCS7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XAB2Q9HCS7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XAB2Q9HCS7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XAB2Q9HCS7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XAB2Q9HCS7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XAB2Q9HCS7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XAB2Q9HCS7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XAB2Q9HCS7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XAB2Q9HCS7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XAB2Q9HCS7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XAB2Q9HCS7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XAB2Q9HCS7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XAB2Q9HCS7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XAB2Q9HCS7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XAB2Q9HCS7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
XAB2Q9HCS7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
XAB2Q9HCS7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
XAB2Q9HCS7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
XAB2Q9HCS7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XAB2Q9HCS7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XAB2Q9HCS7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XAB2Q9HCS7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XAB2Q9HCS7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XAB2Q9HCS7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XAB2Q9HCS7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XAB2Q9HCS7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XAB2Q9HCS7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
XAB2Q9HCS7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XAB2Q9HCS7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
XAB2Q9HCS7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XAB2Q9HCS7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XAB2Q9HCS7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XAB2Q9HCS7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XAB2Q9HCS7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XAB2Q9HCS7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XAB2Q9HCS7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XAB2Q9HCS7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XAB2Q9HCS7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XAB2Q9HCS7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XAB2Q9HCS7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
XAB2Q9HCS7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms